蛋白质结构分析

大连大学医学院生物信息学伦永志目录DNA测序技术序列的获取序列的相似性查询多序列比对蛋白质结构分析蛋白质综合信息查询蛋白质一级结构分析蛋白质二级结构分析蛋白质结构域分析蛋白质三级结构分析PILRA功能结构域蛋白质综合信息查询蛋白质综合信息查询蛋白质一级结构分析蛋白质一级结构分析蛋白质二级结构分析蛋白质二级结构分析蛋白质二级结构分析蛋白质二级结构分析蛋白质结构域分析蛋白质三级结构分析蛋白质三级结构分析不同的蛋白质序列经折叠可产生类似的三维构象，因此蛋白质结构骨架的多样性远少于序列的多样性。随着蛋白质结构数据库中数据量的增加，目前采用同源建模、从头预测和折叠识别三种方法对蛋白质三维结构进行初步模拟。同源建模是基于目的结构序列与已知蛋白质序列的显著相似性（25%）模拟其蛋白质三维结构，是目前最常用的方法。蛋白质三级结构分析从头预测是通过搜索分子的空间构象，结合分子力学及分子动力学理论计算进行结构预测，发现能量最低的构象，适合做未知小分子结构预测。折叠识别是基于很多序列无相关性的蛋白质具有相似的折叠模式，通过目的蛋白质的氨基酸序列与已知折叠模式的逐一比对，以确定能量最优和构象最稳固的折叠模式，是目前发展最快和最有前途的方法。可信度0~1Anolea每个氨基酸与环境相互作用的能量Qmean三维结构的能力分布Gromos氨基酸位点的能量目录DNA测序技术序列的获取序列的相似性查询多序列比对蛋白质结构分析