miRNA研究比较

miRNA研究各种microRNA芯片产品（1）三线产品Affymetrix美国：所有物种包括动植物的miRNA混点在一起，市场接受度低。Illumina美国：已经停产，退出市场，目前市场上的芯片为最后一批存货，已经过期。Invitrogen美国：已退出国内市场，目前几乎没有客户应用。（2）二线产品台湾华联miRNA芯片：•Sanger数据库17.0版本•分类物种芯片：人、啮齿类（大鼠、小鼠）•预合成oligo喷墨点样芯片•良好的性价比（3）一线产品Agilent美国LC-Science美国Exiqon丹麦三个一线产品评价一、LC-science优点：制作灵活，随时增加miRNA，可灵活添加定制序列可及时跟踪高版本探针信息，芯片版本更新及时缺点：灵敏度稍低，检测极限100attomole检测跨度小，动态范围3.5logs样品量5µgTotalRNA美国服务,非本土，样品要送到美国，不便利。价格偏高。二、Exiqon优点LNA专利技术(lockednuclearacid)，信号强无需纯化,一步法标记上市早，因此发表文献多弱点：不少用户反应假阳性高，芯片筛选出的miRNA用定量PCR验证不出来。检测下限：1attomole检测跨度：3logs，检出的miRNA较少三、Agilent优点：独特专利，保证只检测到成熟的miRNA，别的芯片做不到这一点。高灵敏度，超宽检测范围---5log，极低的检测下限0.1attomole缺点：每个slide上8个array，如果样品不足8个或8的倍数，需要凑片。除此以外，尚无其他明显弱点。AgilentmiRNA芯片详介miRNA检测面临的几大挑战1、很小，只有20多个碱基2、相对保守，高度同源3、前体和成熟miRNA同时存在4、表达的动态范围很广5、数据库不断更新AgilentmiRNA芯片技术特点1.特殊的探针设计，保证只识别成熟miRNA，专利独享,其他芯片无法做到。2、高度灵敏，可识别一个碱基差异，检测下限0.1amolAgilentmiRNA芯片技术特点3、宽的动态检测范围：检测丰度跨5-6个logs，有利于检测到更宽丰度范围的miRNA。4、高重复探针，每个miRNA重复约20次，数据更精准。AgilentmiRNA芯片技术特点5、样品需求量低，只需要100ng总RNA6、不需要分离miRNA，避免丢失及引起误差AgilentmiRNA芯片技术特点7、良好的实验表现，平均CV一般小于10%，技术重复R2﹥0.99R²=0.999405000100001500020000250003000035000050001000015000200002500030000H2H1AgilentmiRNA芯片技术特点用AgilentmiRNA芯片检出的差异miRNA，要比Exiqon的更全面GEO：ttp://=GSE18782Pubmed：文章名称：LackofchangeinmicroRNAexpressioninadultmouseliverfollowingtreatmentwithbenzo(a)pyrenedespiterobustmRNAtranscriptionalresponse关键句子：wefoundnochangesinmiRNA.ThiswasconfirmedontwomicroarrayplatformsandbyqRT-PCR.Analysisofpositivecontrols(2distinctreferencepools)indicatedthattheAgilenttechnologycouldidentifydifferencesinmiRNA.MicroRNAexpressionlevelsinadultmouseliverweremeasuredusingExiqonmiRNAarrays.OurresultsindicateadistinctlackofeffectofBaPofmiRNAexpression,despitewidespreadchangesinmRNAlevels(measuredusingAgilentarrays).LackofmiRNAchangeswasconfirmedwithAgilentmiRNAarrays.关键点：作者发现用AgilentmiRNA芯片检出的差异miRNA，要比Exiqon的更全面，换句话说，用Exiqon检测不出来的差异表达miRNA,作者又用Agilent平台进行补充。并且，差异表达的miRNA也在qPCR中，得到了验证。？？为什么选择欧易生物的技术服务平台优秀的软硬件：完整的agilent硬件系统：杂交炉、扫描仪、2100样品质控系统专业的技术操作人员：六年agilent芯片实验操作经验（表达谱、miRNA芯片、aCGH芯片）专业的生物信息分析人员，熟悉各种算法和软件，可以编程，三年芯片数据分析经验，阅读过大量的文献。更高的企业标准:(1)严格遵循agilent标准Protocol，不作任何改动和删减，不更换任何试剂。（2）更多质控环节，更多安全措施，确保更高的成功率，更低的样品损失及实验失败风险。（3）可以参与实验，接受客户监督，更加透明和可信。更高端的生物信息分析结合最新文献，提供更多分析思路和分析方案与客户充分互动，更多个性化体贴多个靶基因数据库同时考虑，分析更加全面完善的后续定量PCR验证支持三年来，我们持续专注于miRNA的定量检测，为几百位客户提供过相关服务。利用Taqman探针法、加尾法（染料法）、颈环法（染料法）多种方法同时为客户提供定量验证，客户可任意选择。严谨的科学作风尊重科学、尊重事实、务求严谨、不弄虚作假。优秀的服务理念核心团队平均6年以上技术服务领域工作经验，均具备良好的职业操守及服务客户理念。给我们一个机会，我们会竭力让您满意！欧易值得您的期待！祝福您及所有科研用户，开创无限可能！