肿瘤基因检测与个体化用药

肿瘤基因检测与个体化用药精准医学研究所洛阳中科信息产业研究院肿瘤防治形势-----严峻22012中国肿瘤登记年报我国每年新发肿瘤病例约为：肿瘤三大治疗手段3约90%肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物抗肿瘤药物使用原则有效（**肿瘤治疗指南，推荐治疗方案）低毒（病人身体情况）经济卫计委《抗肿瘤药物临床应用指导原则》不同肿瘤药物疗效比较5肿瘤类型反应率反应持续时间（月）生存期（月）乳腺癌25-55%6-1224-36结肠癌25-35%6-812-18食管癌30-50%4-66-9非小细胞肺癌20-30%4-66-9胃癌20-50%4-66-12黑色素瘤15-25%4-66-9胰腺癌10-25%3-56-9肝细胞癌5-15%2-46-9胆管癌15-25%2-46-9MedicalCollegeofWisconsin#099Chemotherapy:ResponseandSurvivalData,Author(s):DavidEWeissman,CharlesFvonGunten,April2009.药物不良反应—严重•占据全球主要死亡原因第4-6位•我国因药物不良反应住院人数250万/年•因药物不良反应死亡人数约20万/年6循证医学模式下的抗肿瘤用药以群体医疗数据为依据，其实存在个体差异；治疗方案的选择依据的是肿瘤的解剖学部位，应着重考虑同一肿瘤的基因差异；7临床中使用的个体差异检测手段8检测技术药物检测基因/蛋白荧光原位杂交伊马替尼BCR-ABL基因融合第一代测序西妥昔单抗，帕尼单抗KRAS基因突变IHC3+或IHC2+/FISH+曲妥珠单抗HER2过表达第一代测序吉非替尼，厄洛替尼，埃克替尼EGFR基因敏感突变传统基因检测方法的临床局限性•第一代测序检测不到低频突变，假阴性率高•一次只能测一个基因•所需样本量大，穿刺样本耗尽，患者失去其它基因检测和个体化治疗的机会9检测手段点突变片段变异灵敏度优缺点原位荧光杂交不可以1kb高只能检测已知的融合基因第一代测序可以可以15-20%灵敏度低，一次检测一个基因第二代测序10灵敏度低，15-20%一次测序检测一个基因第一代测序第二代测序灵敏度高，0.5%一次测序检测多个基因，美国第二代测序临床应用--举例11临床病历资料女性，58岁，病理诊断为转移性胸腺癌；胸腔和肝内病灶增大迅速基因检测结果KIT基因突变（在此种肿瘤非常罕见）临床治疗KIT蛋白激酶抑制剂伊马替尼，一天一次，连续1月RECIST标准疗效评价，SD（疾病稳定）伊马替尼治疗前伊马替尼治疗1个月12产品简介13通过第二代测序检测患者肿瘤组织和正常组织的88个基因，找出体细胞突变和某些多态性位点，结合患者的其他临床信息，借助晶云的药物基因组知识库和大数据算法，为医生提供最优的用药方案参考。基因突变及多态性个性化用药分析报告药物基因组知识库为什么是88个基因•药物基因组数据库、文献挖掘•国内外靶向药伴随诊断的基因•化疗药代谢有关基因•化疗药有效性的标记基因•国内药物临床试验入选标准中提到的基因•文献中报道的可能耐药基因14自主研发的药物基因组知识库•基于PharmGKB、SNPedia数据库，加上文献挖掘，收录对药物在人体内吸收、代谢、疗效及不良反应产生影响的基因变异•国内外药物临床试验数据库15个性化用药分析报告16临床分析报告中的三大内容•推荐合适的靶向药、化疗药•提醒靶向药原发性耐药•推荐患者参加国内外药物临床试验17推荐合适的靶向药18靶标靶向药EGFR吉非替尼，厄洛替尼，埃克替尼KRAS,BRAF,PIK3CA西妥昔单抗，帕尼单抗，尼妥珠单抗KIT,PDGFRA伊马替尼，舒尼替尼BRAF维罗菲尼，达拉菲尼ALK,ROS1,MET克唑替尼，色瑞替尼EGFR-TKI药物与EGFR基因敏感性突变•埃克替尼的适应症•本品单药适用于治疗表皮生长因子受体（EGFR）基因敏感突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌（NSCLC）患者的一线治疗•不推荐本品用于EGFR野生型非小细胞肺癌患者•埃克替尼的用药问题•10%EGFR基因敏感突变的患者原发性耐药19靶向药原发性耐药提醒•EGFR-TKI药物原发性耐药的机制•EGFRT790M•ALK基因重排•RAS基因突变•BRAF基因突变•PTEN基因突变20推荐合适的化疗药21检测靶标药物ERCC1,BRCA1,XRCC1,ERCC2,GSTP1顺铂，卡铂，奥沙利铂TYMS,DPYD,MTHFR氟尿嘧啶，卡培他滨RRM1,CDA吉西他滨MTHFR,DHFR甲氨蝶呤TYMS培美曲塞UGT1A1伊立替康，托泊替康TOP2A,CYP3A4依托泊苷，替尼泊苷CYP2C9,CYP2C19环磷酰胺，异环磷酰胺NQO1丝裂霉素TOP2A,GSTP1多柔比星，表柔比星ERCC1,CDA多态性与铂类药物使用22肺癌患者ERCC1基因CDA基因CDA基因推荐患者参加国内外药物临床试验23服务流程24•肿瘤组织样本•第二代测序法25感谢2627肿瘤组织样本要求28一、石蜡组织标本①手术样本（大样本）：切片25张以上（防脱玻片），厚度5μm，肿瘤细胞占比≥50%，坏死组织区域＜10%；穿刺样本（小样本）：切片35张以上（防脱玻片），厚度5μm，肿瘤细胞占比≥50%，坏死组织区域＜10%。②切片时注意对切片机及台面进行消毒处理，不同样本更换新刀片，防止交叉污染。③切片时摊片即可，无需烤片处理，切片编号规范清晰。④为保证石蜡标本DNA提取的成功率，请尽可能送检1年以内的蜡块或6个周以内的石蜡切片。⑤标本存放于塑料玻片盒中，4-8℃保存、运输。肿瘤组织样本要求29二、新鲜组织标本①手术样本（大样本）：肿瘤组织≥50mg，肿瘤细胞占比≥50%，坏死组织区域＜10%；穿刺样本（小样本）：穿刺1针以上，肿瘤细胞占比≥50%，坏死组织区域＜10%。②收到组织后立即用至少5倍体积的10%中性福尔马林固定液固定，置于贴好标签的标本瓶中，于4-8℃条件下72h内送达实验室（穿刺样本尽量48h内送达）。肿瘤组织样本要求30三、胸水①胸水细胞沉渣：胸水沉渣3000rpm离心5min，将沉渣所得细胞转入1.5mlEP管中，封口膜封管口，管盖和管壁标记姓名编号，4-8℃条件下保存、运输。②胸水细胞沉渣石蜡切片：将胸水细胞沉渣制作成石蜡包埋蜡块，4-8℃条件下送检蜡块或按照石蜡组织样本要求切片后送检。产品升级临床应用推荐合适的靶向药、化疗药靶向药抗药性预测推荐患者可参与的药物临床试验依据本产品使用者的反馈，推荐标准治疗方案科学研究发现驱动基因发现预后基因3132精准医学的核心内涵是三个集成：1.基因蛋白与代谢组学的集成；2.临床和影象信息的集成；3.大数据信息的集成与分析。于金明检测基因列表（部分）33循证医学的进步-靶向治疗个体差异检测•FISH•基因芯片•第一代测序•……34靶向治疗•2001年月，分子靶向药伊马替尼在美国上市