连锁遗传-辽东学院

第三章连锁遗传刘丹梅2005.9摩尔根(T.H.Morgan,1866-1945)第一节连锁遗传的表现香豌豆(Lathyrusodoratus)两对相对性状杂交试验.花色：紫花(P)对红花(p)为显性；花粉粒形状：长花粉粒(L)对圆花粉粒(l)为显性。–1.紫花、长花粉粒×红花、圆花粉粒.–2.紫花、圆花粉粒×红花、长花粉粒.组合一：紫花、长花粉粒×红花、圆花粉粒结果：–F1两对相对性状均表现为显性，F2出现四种表现型；–F2四种表现型个体数的比例与9:3:3:1相差很大，并且两亲本性状组合类型(紫长和红圆)的实际数高于理论数，而两种新性状组合类型(紫圆和红长)的实际数少于理论数。组合二：紫花、圆花粉粒×红花、长花粉粒结果：–F1两对相对性状均表现为显性，F2出现四种表现型；–F2四种表现型个体数的比例与9:3:3:1相差很大，并且两亲本性状组合类型(紫圆和红长)的实际数高于理论数，而两种新性状组合类型(紫长和红圆)的实际数少于理论数。连锁遗传现象.–杂交试验中，原来为同一亲本所具有的两个性状在F2中不符合独立分配规律，而常有连在一起遗传的倾向，这种现象叫做连锁(linkage)遗传现象。遗传学上把不同性状常常联系在一起向后代传递的现象称为连锁.–相引组(couplingphase)与相斥组(repulsionphase).描述亲本花色花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传P1紫花(显)长花粉粒(显)两个隐性性状连在一起遗传P2红花(隐)圆花粉粒(隐)一个显性性状与另一个隐性性状P1紫花(显)圆花粉粒(隐)一个隐性性状与另一个显性性状P2红花(隐)长花粉粒(显)相引相相斥相描述亲本花色花粉粒形状两个显性性状连在一起遗传P1紫花(显)长花粉粒(显)两个隐性性状连在一起遗传P2红花(隐)圆花粉粒(隐)一个显性性状与另一个隐性性状P1紫花(显)圆花粉粒(隐)一个隐性性状与另一个显性性状P2红花(隐)长花粉粒(显)相引相相斥相第二节连锁遗传的验证连锁遗传的解释:(一).每对相对性状是否符合分离规律？(二).非等位基因间是否符合独立分配规律？每对相对性状是否符合分离规律？YES两对相对性状是否符合自由组合？F2不符合9:3:3:1的比例F1形成的四种配子的数量不相等NO验证连锁遗传的验证测交法：测定杂种F1产生配子的种类和比例赫钦森(C.B.Hutchinson,1922)玉米测交试验籽粒颜色：有色(C)、无色（c）籽粒饱满程度：饱满(Sh)、凹陷(sh)–相引相测交试验；–相斥相测交试验。试验结果分析：1.F1产生的四种类型配子比例不等于1:1:1:1；2.亲本型配子比例高于50％，重组型配子比例低于50％；3.亲本型配子数基本相等，重组型配子数也基本相等。测交：相引相测交：相斥相亲本表现型亲本基因型F1表现型F1基因型Ft表现型有色饱满有色凹陷无色饱满无色凹陷Ft基因型CcShshCcshshccShshccshshFt个体数6382137921096672比例(%)1.548.848.21.5有色饱满CcShsh有色凹陷无色饱满CCshshccShSh第三节连锁与交换的遗传机理1、基因在染色体上呈直线排列。2、某一基因C与其等位基因位于一对同源染色体的2个成员上，它们的位置相当，呈对称排列。3、同源染色体上有2对不同的基因时，它们处在不同的位点上。4、染色体经过复制，形成两条染色单体，上面的基因也随着复制。减数分裂前期同源染色体配对后，形成四合体。5、交换只涉及到两条非姊妹染色单体。先在两基因位点之间某一位置上发生断裂，然后在非姊妹染色单体之间重新连结起来，随着染色体节段的互换，基因也随着得到了交换。6、交换后形成的四种基因组合的染色单体，通过两次细胞分裂，分配到4个子细胞（即孢子）中去，以后发育成四种配子，包括2个亲本和2个新组合。第四节交换值及其测定交换值(cross-overvalue)，也称重组率/重组值，是指重组型配子占总配子的百分率。即：％总配子数重组型配子数交换值100(%)亲本型配子+重组型配子交换值的测定(一)、测交法–测交后代(Ft)的表现型的种类和比例直接反映被测个体(如F1)产生配子的种类和比例。–相引相与相斥相的测交结果：C-Sh相引相的交换值为3.6%；C-Sh相斥相的交换值为3.0%。C-Sh基因间的连锁与交换香豌豆P-L基因间交换值测定设F1产生的四种配子PL,Pl*,pL*,pl的比例分别为：a,b,c,d；则有：a+b+c+d=1a=d,b=c（二）自交法PL(a)Pl(b)*pL(c)*pl(d)PL(a)Pl(b)*pL(c)*pl(d)F2的4种表现型(9种基因型)及其理论比例为：P_L_(PPLL,PPLl,PpLL,PpLl)：a2+2ab+2ac+2bc+2adP_ll(PPll,Ppll)：b2+2bdppL_(ppLL,ppLl)：c2+2cdppll：d2d2而F2中双隐性个体(ppll)的实际数目是可出直接观测得到的(本例中为1338)，其比例也可出直接计算得到(1338/6952)，因此有：%1212.006.006.006.02)(144.044.0192.0%2.19%100695213382cbLPdacbdadpld间交换值：两种重组型配子的比例：两种亲本型配子的比例配子的比例：相斥相的分析：451.02)(1%8.9098.0049.0049.0049.0049.000239.0%239.0%10041912dacbdaLPdadpldppll：两种亲本型配子的比例间交换值：两种重组型配子的比例配子的百分率：的百分率：双隐性个体交换值与遗传距离1.非姊妹染色单体间交换数目及位置是随机的；2.两个连锁基因间交换值的变化范围是[0,50%]，其变化反映基因间的连锁强度、基因间的相对距离；–两基因间的距离越远，基因间的连锁强度越小，交换值就越大；反之，基因间的距离越近，基因间的连锁强度越大，交换值就越小。3.通常用交换值/重组率来度量基因间的相对距离，也称为遗传距离(geneticdistance)。–通常以1%的重组率作为一个遗传距离单位/遗传单位。完全连锁和不完全连锁完全连锁(completelinkage)：如果连锁基因的杂种F1(双杂合体)只产生两种亲本类型的配子，而不产生非亲本类型的配子，就称为完全连锁。即同一染色体上非等位基因不发生分离而被一起传递到下一代的现象。不完全连锁(incompletelinkage)：指连锁基因的杂种F1不仅产生亲本类型的配子，还会产生重组型配子。这就是非等位基因间的不完全连锁。完全连锁(completelinkage)ABab不完全连锁(incompletelinkage)基因间的距离与交换值、遗传距离、连锁强度基因定位(genelocation/localization)：确定基因在染色体上的相对位置和排列次序。第五节基因定位连锁分析的方法基因连锁分析的主要方法：(一)、两点测验(two-pointtestcross)–通过三次测验，获得三对基因两两间交换值、估计其遗传距离；每次测验两对基因间交换值；根据三个遗传距离推断三对基因间的排列次序。(二)、三点测验(three-pointtestcross)–一次测验就考虑三对基因的差异，从而通过一次测验获得三对基因间的距离并确定其排列次序。两点测验1.通过三次亲本间两两杂交，杂种F1与双隐性亲本测交，考察测交子代的类型与比例。例：玉米第9染色体上三对基因间连锁分析：子粒颜色：有色(C)对无色(c)为显性；饱满程度：饱满(SH)对凹陷(sh)为显性；淀粉粒：非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性.(1).(CCShSh×ccshsh)F1×ccshsh(2).(wxwxShSh×WxWxshsh)F1×wxwxshsh(3).(WxWxCC×wxwxcc)F1×wxwxcc两点测验的3个测交结果2.计算三对基因两两间的交换值估计基因间的遗传距离。3.根据基因间的遗传距离确定基因间的排列次序并作连锁遗传图谱。C-Sh:3.6Wx-Sh:20Wx-C:22两点测验的局限性1.工作量大，需要作三次杂交，三次测交；2.不能排除双交换的影响，准确性不够高。–当两基因位点间超过五个遗传单位时，两点测验的准确性就不够高。三点测验仍以玉米C/c、Sh/sh、Wx/wx三对基因连锁分析为例，在描述时用“+”代表各基因对应的显性基因。1.用三对性状差异的两个纯系作亲本进行杂交、测交：P:凹陷、非糯性、有色×饱满、糯性、无色shsh++++++wxwxcc↓F1及测交:饱满、非糯性、有色×凹陷、糯性、无色+sh+wx+cshshwxwxcc↓在不完全连锁的情况下测交后代有多少种表现型？测交后代的表现型F1配子种类粒数交换类别饱满、糯性、无色+wxc2708凹陷、非糯、有色sh++2538饱满、非糯、无色++c626凹陷、糯性、有色shwx+601凹陷、非糯、无色sh+c113饱满、糯性、有色+wx+116饱满、非糯、有色+++4凹陷、糯性、无色shwxc2总数6708亲本型单交换单交换双交换2.考察测交后代的表现型、进行分类统计。3.按各类表现型的个体数，对测交后代进行分组；4.进一步确定两种亲本类型和两种双交换类型；5.确定三对基因在染色体上的排列顺序。用两种亲本型配子与两种双交换型配子比较：双交换配子与亲本型配子中不同的基因位点位于中间。–如：+wxc与shwxc相比只有sh位点不同，因此可以断定sh位点位于wx和c之间；–同理，sh++与+++相比也只有sh位点不同，也表明sh位点位于wx和c之间。基因间排列顺序确定6.计算基因间的交换值。–由于双交换实际上在两个区域均发生交换，所以在估算每个区域交换值时，都应加上双交换值，才能够正确地反映实际发生的交换频率。7.绘制连锁遗传图。–Sh位于wx与c之间；–wx-sh:18.4sh-c:3.5wx-c:21.9。*两个思考问题：1.三点测验考虑到了wx与c之间的双交换值，应该比两点测验得到的遗传距离更大。但事实上变小了，为什么？2.各种方法在各次试验中测定的交换值-遗传距离都不相同，倒底哪一个最能反映基因间的遗传距离？如何选择？干扰和符合1.理论双交换值–连锁与互换的机理表明：染色体上除着丝粒外，任何一点均有可能发生非姊妹染色单体间的交换。但是相邻两个交换是否会发生相互影响呢？–如果相邻两交换间互不影响，即交换独立发生，那么根据乘法定理，双交换发生的理论频率(理论双交换值)应该是两个区域交换频率(交换值)的乘积。–例：wxshc三点测验中，wx和c基因间理论双交换值应为：0.184×0.035=0.64%。2.干扰(interference)：–测交试验的结果表明：wx和c基因间的实际双交换值为0.09％，低于理论双交换值，这是由于wx-sh间或sh-c间一旦发生一次交换后就会影响另一个区域交换的发生，使双交换的频率下降。–这种现象称为干扰(interference)，或干涉：一个交换发生后，它往往会影响其邻近交换的发生。其结果是使实际双交换值不等于理论双交换值。–为了度量两次交换间相互影响的程度，提出了符合系数的概念。符合系数(coefficientofcoincidence)符合系数也称为并发系数：用以衡量两次交换间相互影响的性质和程度。例如前述中：符合系数=0.09/0.64=0.14.符合系数的性质：真核生物：[0,1]—正干扰；*某些微生物中往往大于1，称为负干扰。连锁遗传图(linkagemap)1.连锁遗传图(linkagemap)，遗传图谱(geneticmap)。遗传作图(mapping).2.连锁群(linkagegroup)；–连锁群的数目.3.遗传作图的过程与说明。–连锁遗传图绘制的基本过程；–大于50个遗传单位的遗传距离说明什么？要求能够读懂连锁遗传图的信息。玉米的连锁遗