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核磁应用培训笔记一、一维H谱实验操作流程1、新建一个实验,可以直接输入New命令,name:样品名称;PROCNO:处理号;Solvent:不代表锁场的溶剂,只影响最后打印谱图参数中溶剂项的显示;ExpenrimentDirs:标准实验,不代表脉冲系列;User下,可以建立自己的标准实验;H谱的标准实验名称是:proton2、getprosol:把相关的脉冲参数保存在Acqupars表中:Acqupars→PL13、锁场,可以直接点击Lock图表选择溶剂后锁场,或者输入命令LOCK空格溶剂名称直接锁场;锁场的目的?4、atma:topshim5、NS输入数值6、rga7、za即zerogo的简写Notice:(1)调谐:做同一样品的不同谱图时需要重新做一次调谐。(2)当第一次匀场不好的时候,可以输入命令topshim+空格+tunea进行二次匀场,若多次匀场后仍然不能达到好的状态则需要做三维匀场。(3)同一溶剂的样品,建议在同一时段做谱,有利于匀场。(4)匀场不好的原因有以下几个方面:①样品中含有顺磁性金属离子②高粘度样品③溶液高度太低。8、部分参数的设置(1)eda采样参数设置:可以输入命令ased进入参数设置界面;①PULPROG:脉冲系列名称,zg30:30度角激发,zg:90度角激发;②AQ-mod:采样模式③TD:采样点数④NS:采样次数⑤DS:空扫:真正开始采样前先采集的次数,做一维谱时可设为0,二维谱空扫的次数设置非常重要。⑥TD0,真正采样次数,NS*TD0,如TD0设为10,NS为1024,则总采样次数为1024*10⑦SW谱宽,用默认的谱宽即可,其中SW与AQ成反比⑧O1P,O1,中心频率,其中前者是以ppm为单位,后者是以HZ为单位。最右边:谱宽/2+O1P(2)和脉冲系列有关的参数①DE值,采样结束后等待衰减的时间。做杂核时需要更改。②D1:弛豫延迟,做定量H谱时需要更改③P1激发脉宽;PL1(dB):激发功率;9、谱图处理(1)Procpars:窗口函数①efp:指数函数,em、ft、pk三个命令的组合②gfp:高窗函数:gm、ft、pk三个命令的组合③apk:根据当前的样品来调PHC,PHC1,当谱峰有很多鼓包时使用效果不好。Notice:LB值越大信噪比越好,分辨率越差,LB值越小,分辨率越好。LB0是相对于efp函数而言的,当调节LB值为负,信噪比仍然不好时,可用gfp函数,先更改GB值,再输入GFP命令冲零也可以提高分辨率。(2)定标(3)直接输入plot命令,进入打印界面。(4)如何创建模板?C:\Bruker\Topspin\Plot\Layouts,先另取名字创建模板,再将模板文件夹下的默认模板删除,如H谱的默认模板是:1D-Hxwp,先删除该模板,再将自己创建的模板改为默认模板的名字。二、如何做H谱的定量?与标准一维氢谱相比,需要做一下变换1、将脉冲系列zg30改为zg,2、找内标,两个峰挨的很近且基线分离,一般很难找到合适的内标物。3、调整O1P,使得O1P在两个峰之间4、NS要足够大,为了保证较好的信噪比,定量最起码要做半个小时以上。5、D15T1,D1要大于5倍的T1,首先要找最大的T1,D1的时间要足够长。三、碳谱:碳谱的标准实验为C13CPD1、getprosol2、atma3、采样参数的设置:谱宽sw一般设置为250,O1P,NS,TD0,4、rga5、zg6、tr命令:保存数据,继续采样;如tr4,保存最近4次的2倍。7、efp:apk8、ppf:对碳谱的全谱进行标峰。9、Mi+数字+PPF:表示强度低于该数值的不标峰。10、go命令,样品浓度太低的情况下,过夜采集仍然不能得到理想的谱图,第二天白天需做其他谱图,可在第二天晚上将前一天晚上采集的谱图拖动到当前窗口,重新放入样品锁场调节后可以输入GO命令进行累加采集。11、和脉冲相关的参数CPDPRG2,通常情况下用Waltz16,做氢谱、碳谱的90度脉冲没有问题,做杂核时需要更改。Notice:看到碳谱有裂分,首先要考虑是否有同分异构体,再考虑更改CPDPRG2,选择带bi的参数。四、碳谱定量实验(实验时间相对很长,需要加弛豫试剂以减短实验时间。)1、标准实验选择CBIG,new→ok2、将zgig30改为zgig3、DS:0加弛豫试剂后会影响锁场和匀场。五、DEPT实验(45°、90°、135°)1、New→C13DEPT90→OK2、getprosol3、修改参数:(1)改动参数NS,采样次数是普通碳谱采样次数的1/4.(2)Pulseprog查看与脉冲相关的参数,其中NS是4的倍数。(3)DS=8,NS=4,SW:谱宽,O1P.4、rga:zgNotice:(1)DEPT45,只出现季碳;DEPT135:只出现CH(2)HALT空格数字(3)SR值,从校正后的普通碳谱的处理参数中copySR值,复制到DEPT谱图中,可将DEPT谱图中的化学位移与普通C谱的化学位移对齐。六、如何将多种谱图打印在同一张图上?方法一:1、先将全谱图调出并标好化学位移。2、选择1D+1D+1Dxwp打印模板3、在data中,点击ADD,选择实验数据现在的位置,将需要的数据拖入,点击Apply,确定。此方法的优点是可以对每一张谱图进行修改。、方法二:1、随意拖入一张谱图,输入plot2、全选中,并删除原有谱图3、在DATA里面选谱图,APPLY→OK;4、在右侧选择多个谱图叠加的图标,三条重叠的折线;5、在空白处拖动鼠标,出现第一张谱图6、右击选择Edit,选择steaked,输入谱图张数。Spectra:0*5,0表示左右偏移量,5表示上下偏移量。此方法的缺点是不能单独修改每一张谱图。七、一些补充注意事项1、BBf,探头。2、新安装仪器可以做的核有H、C、P、F、N,可以直接选择标准实验,直接调用标准模板。P31CPD,全去偶,zgpg30;P31:zg。LOCK之后可以直接输入一系列命令,点击ENTER直接完成。3、做杂核前要先确认两件事情:(1)有无脉宽和功率(2)有无标准实验;4、P的化学位移的标定:外标法。把标准品(查找网上文献)放到P样品中测定核磁,将标准品的化学位移定位为0后看SR值,再将SR值复制粘贴到后续做的P谱图上,再标定化学位移。标准品:85%磷酸溶液。不锁场、不匀场,直接调谐、prosol。不锁场实验:(1)打开BSMS键盘,将lock变成灰色。(2)sweep要变成灰色(即将(1)(2)的ON-OFF都OFF掉)(3)atma;rga;zg;八、对于没有标准实验、没有脉宽和功率的杂核如何入手做?以B11为例。1、首先查询该杂核的旋磁比、天然丰度,对于天然丰度太低的要求浓度高些,或者很难做出来。Help→NMRGuid→eNMREncyclopedia→NMRApplication→NMRpenddicTable→点击要做的元素查看旋磁比和天然丰度。2、先借用C谱的标准实验,新建一个实验,当旋磁比为正时标准实验选择C13CPD,当旋磁比为负时标准实验选择C13IG。点ok。3、更改参数查看Acqpar参数(都是C13的参数)→getprosol(读取C的脉宽和功率)→输入edsp命令→把F1维中的C13改为B11,F2维不变→Default→Save→再次回到Acqupars参数中→NS(扫描次数)、SW(谱宽,尽量设宽些400),O1P(先赋予0)+-200位置找峰,D1(经验值)2S,对0也适合,(事先查D1值,太大可加弛豫试剂)→lock,topshim→输入atmm(不能用atma,手动调谐,第一次做核时必须用手动调谐。)→出现Tuning对话框,若点》《找不到会动的倒峰,则点击▽图标,放大范围,都调好后点①File②Saveposition③Exit→输入atma;rga;zg,弹出rga对话框,点OK,输入密码Bruker,接着弹出zg警告→halt8,efp;apk→输入sref弹出警告,close(将O1P放在最佳位置)→edmac(宏命令)+空格+名称(随意命名)。校准背景信号,第一段(第一行,absf1+空格+最大值;第二行,absf2+空格+次大值;第三行,absf);第二段(第一行,absf1+空格+最大值;第二行,absf2+空格+次大值;第三行,absf);Notice:下一段的开始是上一段的结束,进入鼓包区域后区间要变小,节点值不能正好落在峰的最高点,从最左端分多段编辑到最右端。编辑好后保存。→输入BL命令4、如何创建标准实验模板?输入wpar→在user下,不能存在par上面→点击writenew→输入实验名称,OK→OK→close→new→不能getprosol(90%重水10%水叠代钠标样,可以用来建立O的标准实验,也可以用来建立Na的标准实验,需要做Pt的标准实验室,可打电话让工程师过来设置,另外做其他杂核的定量需用到C13IG脉冲系列,需要请工程师调90度脉冲的脉宽和功率,请工程师来做核。)九、部分二维实验温馨提示:二维谱实验最重要的就是控温。(一)、实验一1、New建立一个新实验,标准实验选择COSYGPMFSW:用梯度场进行相关路径的选择。其中GP表示梯度;MF表示多量子粒波,SW表示方波,标准波形。多量子粒波的好处:可以从对角峰上看到单峰的性质,简化对角峰,易于解析。2、lock3、atma;topshim;getprosol,调谐的目的是为了接收线圈的频率与中心频率保持一致,提高灵敏度。DS空扫16次。Pulseprog:查看脉冲系列。TD,F2维2000左右;F1维,大于256(设高一点可以提高分辨率)。采采样模式:QF;与采样相关的参数:TD、NS、DS、SW、O1P。其中NS、DS的设置可以参考限定值。输入命令ased,可以查看与脉冲系列相关的参数,基本不需要自行修改。4、rga;zg5、谱图处理(1)输入命令xfb进行变换,其中xf表示加窗函数,b表示两个维度。(2)调进一维谱①选中一维谱,右击,选择displayAs2Dprojection。②选F1+F2(3)点等高线调整图标(一个没有底边的三角弧形,中间几条平行线穿过)进行等高线调整。Levelincrement:1.2-1.3即可;Numberoflevels(等高线数):32;Fill→Apply→OK。或者可以输入命令clev+32可得到等高线数目。(4)校准(即定标)放大谱图进行定标。(5)去除噪音,选中噪音,输入命令proj,选择UPdatarows/colsfromdisplay→ok→再选择最上面的calculatepositiveprojection→输入sub2(对正峰和负峰都去除噪音)(二)、实验二1、New,标准实验选择:MLEVPHSW,PH表示相位;MLEV表示自旋锁定或自旋传递;SW表示方波,形状脉冲SP;①查看与脉冲系列相关的参数,其中NS=8*n,DS=16*n;②TD(F2=2048,F1≥256)③SW,O1P;④D9:自旋锁定时间,默认值为0.08S,即混合时间(设短的话可能会无法调整相位)2、lock3、atma;topshim;getprosol;4、谱图处理(1)输入命令xfb变换谱图(2)调等高线(3)调相位,先调0级相位,再调1级相位。(4)校准(三)实验三1、New→NOESYPHSW→适用于大分子2、①NS:8*N;DS:16*N;②D8混合时间,空间<5À,峰的强度与距离的六次方成正比。对于大分子,D8=0.1~0.3S;对于小分子:D8=0.6~0.8。Notice:分子量越大,弛豫时间越短,分子量越小,弛豫时间越长,温度越高弛豫时间越短。3、lock4、getprosol5、atma;topshim;rga;zg(四)实验四1、new,标准实验选择ROESYPHSW,PH:通过相位循环可以减掉一些峰。2、具体实验步骤与前面的实验步骤大致相同,通过查看与脉冲系列相关的参数对参数进行设置。接着LOCK,getprosol;atma;t
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