RNA建库流程

RNA建库流程葛玮珍2014.4.111FromWeihuaZeng&AliMortazaviNatureimmunology一、RNA-seq实验流程样品制备样品检测文库构建文库库检上机测序二、文库类型RNAmRNADGE文库真核普通转录组文库真核链特异性文库原核链特异性文库Non-codingRNAlncRNA文库SmallRNA文库根据研究对象不同选择相应的建库方法：mRNA/lncRNA建库流程TotalRNAoligodT磁珠富集mRNA打断、双链cDNA合成末端修复、加A加接头片段选择PCR扩增、纯化Ribo-zerokit去除rRNA文库质量检测上机测序真核mRNA原核mRNA/lncRNA4OligodT磁珠富集mRNARibo-zerokit去除rRNA5产品厂家货号规格Ribo-ZeroMagneticKit（bacteria）EpicentreMRZB124246/24RxnsRibo-ZeroMagneticKit(PlantLeaf)EpicentreMRZPL1166/24RxnsRibo-ZeroMagneticKit(PlantSeed/Root)EpicentreMRZSR1166/24RxnsRibo-ZeroMagneticGoldKit(Epidemiology)EpicentreMRZE7066/24RxnsRibo-ZeroMagneticGoldKit(Human/Mouse/Rat)EpicentreMRZG123246/24RxnsRibo-zerokit去除rRNA6Ribo-Zero™KitSelectionGuide普通转录组、DGE文库链特异性文库SmallRNA文库构建流程POH如何避免降解的mRNA/rRNA等污染：样品严格质检，RIN值合格。PAGE胶电泳纯化，回收符合smallRNA大小的片段（140-160bp）。M1111M2160bp140bpQ&A?10