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Trizol中文说明书TRIzol试剂是一种从组织及细胞中提取总RNA的专用试剂。这种试剂是一种酚和硫氰酸胍的单相溶液,是将Chomczynski和Sacchi发明的一步RNA提取法的改进。在样品匀浆或分析过程中,TRIzol试剂可在分裂细胞及溶解胞膜的同时保持RNA的完整。在匀浆后加入氯仿,可将溶液分为水相和有机相。RNA均在水相中。吸取水相加入异丙醇,得到RNA沉淀。去除水相后,样品中的DNA及蛋白质可通过进一步连续的沉淀而得到。中间相加入乙醇可沉淀DNA而有机相加入异丙醇则能沉淀出蛋白质。DNA的再纯化可能对标化样品的RNA产量有作用。2.这一技术可以用于人,动物,植物或细菌株的微量组织(50—100mg)及细胞(5×106),也可以用于大量检材(≥1g)及细胞(﹥107).该方法简便易行,可用于同时检测大量样品,全部过程1小时内可以完成.用TRIzol试剂分离的RNA没有DNA及蛋白质成分.这种RNA可用于Northern印迹分析,斑点杂交,多聚(A)+检出及Vitro转移,RNA酶蛋白分析及分子克隆.用于PCR反应时,当两个引物位于同一外显子时应用扩增特异DNA酶I处理提取出的RNA.3.TRIzol试剂可用于分子量从大到小的各种RNA的提取.例如,大鼠肝脏提取出的RNA,经琼脂糖凝胶电泳,EB染色后可显现出7kb和15kb的大分子量的RNA谱带(包括mRNA和hnRNA),位于~5kb(28s)和~2kb(18s)的两条主要的核糖体RNA谱带及大小在0.1kb-0.3kb之间的低分子量RNA(tRNA,5s).分离出的RNA当溶于双蒸水中时A260/280为1.6-1.8之间.每毫克组织所能提取的RNA量约为:肝和脾,6-10μg;肾,3-4μg;骨骼肌和脑,1-5μg;胎盘,1-4μg.从1×106培养细胞中提取的RNA量约为:上皮细胞,8-15μg;成纤维细胞,5-7μg.需要但未提供的试剂:1.氯仿2.异丙醇3.75%乙醇(DEPC处理水配制)4.无RNA酶水或0.5%SDS溶液(制备无RNA酶水:将水倒进无RNA酶的玻璃容器中,加入DEPC至0.01%(v/v)放置过夜后高压灭菌).SDS溶液必须用DEPC处理后高压灭菌的水配制.RNA分离提取步骤:1.匀浆a.组织每50-100mg组织加入1ml的TRIzol试剂后用匀浆机或玻璃棒匀浆。样品的体积不要超过匀浆使用的TRIzol试剂体积的1/10。b.单层培养细胞在一个直径3.5cm的培养皿中加入1mlTRIzol试剂来溶解细胞,用移液器反复吸打细胞溶液。加入的TRIzol试剂的量取决于培养皿的表面积(每10cm2加入1ml)而不是取决于细胞的数目。如果TRIzol试剂的量不足,提取的RNA中会混有DNA。c.悬液中培养细胞离心沉淀细胞,吸取细胞,反复吹打使溶解于TRIzol试剂中。每5~10×106个动物,植物或酵母细胞,每1×107个细菌细胞加入1mlTRIzol试剂。应该避免在加入TRIzol试剂前洗细胞,因为会增加mRNA的变性。破坏某些酵母或细菌细胞需要使用匀浆机。2.选择采用的步骤:对于含有大量蛋白质,脂肪,多糖或其他细胞外物质的样品如肌肉,脂肪,植物的块茎等可能需要再加上一个步骤。匀浆后,2℃~8℃条件下12,000×g离心10分钟去除不溶物质。沉淀中包含有细胞外膜,多糖,大分子量DNA,RNA在上清中。来源于脂肪组织的样品,最上层是脂肪层应该弃去。在每一种情况下,将纯净后的匀浆溶液放在一新管里,加入氯仿即可以有如后面所描述的分层。3.有机相与无机相的分开将匀浆后的样品在15℃~30℃孵育5分钟使核酸蛋白质混合物分裂彻底。每1mlTRIzol试剂加入0.2ml氯仿。小心盖上离心管盖,用手剧烈振摇15秒,15℃~30℃孵育2~3分钟。2℃~8℃条件下,以低于12,000×g离心15分钟。样品分成几层,最下层红色的酚-氯仿层,中间层及无色的上层水相。RNA均在水相中。水相的体积约是用于匀浆的TRIzol试剂体积的60%。4.RNA沉淀将水相转移至一个新试管中,如果需要提取DNA或蛋白质可以保存有机相。用异丙醇从水相中沉淀RNA。匀浆时每使用1ml的TRIzol的试剂加入0.5ml异丙醇沉淀RNA。样品在15℃~30℃孵育10分钟后,2℃~8℃条件下,以低于12,000×g离心10分钟。离心后RNA沉淀通常即可见到,在管底或管壁上形成了胶样的小团块。5.RNA洗涤弃去上清,用75%乙醇洗涤RNA沉淀一次,匀浆时每使用1ml的TRIzol试剂至少加入1ml75%乙醇。涡旋混匀样品,2℃~8℃条件下,以低于7,500×g离心5分钟。6.RNA的再溶解在步骤最后,暂短干燥RNA沉淀(空气干燥或真空干燥5-10分钟),不要在真空下离心干燥RNA。很重要的一点是,不要让RNA团块完全干燥,因为这会大大降低其溶解性。不完全溶解的RNAA260/280<1.6。用无RNA酶水或0.5%SDS溶液溶解RNA,可以用吸头反复吹打,55℃~60℃孵育10分钟(当RNA用于酶学反应时不用SDS)。RNA也可用100%formamide(去离子)溶解储存于-70℃。DNA提取步骤在水相被完全吸取后,正如在RNA分离步骤中所述一样,最初离心后在中间相和酚相中的DNA可以被提取。在沉淀及洗涤后,DNA溶于8mMNaOH。TRIzol试剂可以用于从组织及培养细胞中分离DNA并分析样品中DNA含量的实验,同时,提取基因组DNA可以用于Northern分析的标化,这是因为可以用每个基因组DNA替代更容易变化的总RNA或组织重量。(根据来源不同,在下一步反应前有些获得的DNA沉淀可能需要进一步纯化。需要但未提供的试剂1.乙醇2.溶于10%乙醇中的0.1M柠檬酸钠3.75%乙醇4.8mMNaOH步骤:1.DNA沉淀弃去在中间相上残存的水相,用乙醇沉淀中间相和水相中的DNA。匀浆时每使用1ml的TRIzol试剂加入0.3ml100%乙醇,颠倒混匀样品。将样品在15℃~30℃放置2-3分钟后,2℃~8℃条件下,以低于2,000×g离心5分钟沉淀DNA。(小心弃去水相对提取的DNA的质量十分关键)2.DNA洗涤弃去酚-乙醇组成的有机相上清,如果需要,则保留此上清用于提取蛋白质。用溶于10%乙醇的0.1M柠檬酸钠溶液洗涤DNA沉淀两次。匀浆时每使用1ml的TRIzol试剂,加入1ml上述溶液。每次洗涤时,使DNA沉淀在洗涤溶液中室温(15℃~30℃)30分钟(隔一段时间混匀一次),2℃~8℃条件下,2,000×g离心5分钟。洗涤两次后,将DNA团块置于75%乙醇(每1ml的TRIzol试剂加入1.5-2ml75%乙醇)室温放置10-20分钟(隔一段时间混匀一次)之后,2℃~8℃下,2,000×g离心5分钟。(如果DNA团块很大,含有>200μgDNA或大量非DNA组成,可以多用溶于10%乙醇的0.1M柠檬酸钠溶液洗涤一次)3.DNA的再溶解打开管盖,空气中干燥DNA5-10分钟(不要离心条件下干燥,否则极难溶解)。将DNA溶于8mMNaOH中,DNA浓度为0.2-0.3μg/μl。例如,对从107细胞或50-70mg组织中提取的DNA加入300-600μl的8mMNaOH溶解。由于提取的DNA在水或Tris缓冲液中溶解不好,所以需要将其溶于弱碱溶液中。8mMNaOH的pH值约为9,DNA一旦溶于其中其pH值很容易用TE或HEPES来校准。这一步中,DNA沉淀(尤其来源于组织的DNA)可能带有不溶性的胶状物(碎片或细胞膜等)。大于12,000×g离心10分钟去除不溶物。将含有DNA的上清液移至一个新管中。溶于8mMNaOH的DNA在4℃可以稳定保存几个月,在-20℃可以保存一年以上,在-70℃则可以长期保存。DNA的产量取出一定量溶解在8mMNaOH的DNA,用水稀释混匀后测定上述溶液的A260值。用双链DNA的A260值计算DNA含量。一单位A260相当于每毫升含50微克双链DNA。当计算被检测样品中的细胞数目时,假定人,大鼠及小鼠的每1×106个双倍体细胞中所含DNA量分别为7.1μg,6.5μg,5.8μg。每mg组织中DNA的量约为:肝及肾,3-4μg;骨骼肌,脑及胎盘,2-3μg。来源于人,大鼠及小鼠的每1×106个培养细胞中DNA的量约为5-7μg。用途PCR扩增用DNA将DNA溶于8mMNaOH后,用0.1MHEPES调节pH值到8.4。在PCR反应液中每管加入0.1μg至1.0μg的DNA样品后进行标准PCR程序。限制性核酸内切酶反应讨论结果:TRIzol能同步抽提RNA和DNA;其中RNA的质量很高,而DNA用于某些实验是需要进一步纯化的。基本上,TRIzol抽提的DNA,蛋白质残留是比较多的,所以比值低。按照标准操作,无论怎么仔细,结果都差别不大,这是Tizol方法上的问题。
本文标题:Trizol中文说明书
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