药物筛选之必备武器——化合物库

众所周知，药物筛选是发现药物先导化合物的重要途径，而好的化合物库则是药物筛选的必备武器。什么是化合物库呢？化合物库是由特定结构或功能的实体化合物及其相关信息在某种特定的标准下组成的集合，通常作为新药发现或者细胞诱导的工具来使用，帮助科学家找到新药研发的苗头化合物或者细胞特定功能的实现者。化合物库归类的方法多种多样，根据其性质和来源，市面上的化合物库分为如下三大类：生物活性化合物库，天然产物化合物库和类药多样性化合物库。下面就每一类进行详细介绍：•生物活性化合物库：市面上普遍使用的生物活性化合物库涵盖了4万种生物活性已知的小分子，其中有些是已上市或临床期的药物；有些是经典的有明确靶点的活性小分子；有些是初步文献报道表现出良好生物学活性的化合物。这些小分子可用于药物功能重定位、细胞诱导、药理研究、靶点确认等，属于每个药物筛选平台建立之初的基本配套产品。举例来说，TargetMol的一套近两千种的上市药物库就包含了市场上可以收集的各类疾病对应的化学药物，其生物活性多样性和化学结构多样性都非常高，是一套性价比非常好的入门库。同时，该类库中还有很多广受好评的经典化合物库，如：FDA上市药物库，临床药物库，抗肿瘤库，生物活性经典库和生物活性新颖库等。•天然产物库：天然产物来源丰富，取自植物，动物和微生物的细胞、组织或分泌物，种类繁多，结构多样，含有糖类、糖苷类、苯丙素类、醌类、黄酮类、萜类、类固醇类、生物碱类、酚类、酸类和醛类，是制药行业获得先导化合物的重要来源，常用作高通量筛选或计算机辅助药物设计。•类药多样性化合物库：目前世界上商品化的化合物有5000万个，精选质量可靠，类药多样性好的产品组成类药多样性化合物库，是多达数百万个小分子化合物的集合，是科学研究、新的药物靶点筛选的有效工具，是高通量筛选（HTS），高内涵筛选（HCS）和计算机虚拟筛选的不二选择。这些产品一次可以为高通量筛选的平台提供1万到20万个性价比很高的类药化合物库，非常适合用于建设高通量筛选化合物库平台。除了高通量筛选的化合物库以外，还有基于CADD（ComputerAidedDrugDesign）得到的各种潜在药物靶点库，如GPCR靶点库，CNS靶点库，抗菌库，抗炎库，抗HIV库等。此外，一些特色化合物库以其自身的性质特点为广大药物研发科学家提供了针对性很强的研究工具，包括片段库、大环库、靶向共价抑制剂库等。比如近几年很热门的片段库，其合理使用可以大大提高药物筛选的结构覆盖范围，可用作基于片段筛选，科研人员可以根据其研究目标和方法进行单独选择，构建适合的片段大小和组成；而大环库则包含了通常定义为包含超过12个碳原子或其他重原子的环结构，与等分子量的无环分子相比，大环化降低了分子整体极性并增强了膜的渗透性，可用于筛选某些挑战靶点的先导化合物；靶向共价抑制剂是合理设计的抑制剂，这类抑制剂具有低化学反应性的成键官能团，其在与靶蛋白结合后，与靶位点上的特定亲核残基快速成键，因此具有较高的选择性。除了现有的化合物库之外，完美契合需求的定制化合物库也广受欢迎。你不仅可以选择需要的产品形式如粉末、溶液；还可以选择包装瓶或96孔板，甚至可以从产品的性质进行选择，如上市且具有抗肿瘤活性的药物等。