基于SCIE的抗体研究文献计量分析

国际单克隆抗体研究文献分析1李海存王敏许培扬北京协和医学院医学信息研究所,100020文摘：目的：通过比较分析1999年至2008年单克隆抗体主要研究国家和机构的科研产出及单克隆抗体的研究领域、热点等，为科研工作者和科研管理者提供参考。方法：利用文献计量学方法，对WebofScience(SCIE)收录的单克隆抗体论文的时间、国家、机构、期刊进行分析；同时结合共词分析、聚类分析和可视化分析方法，对单克隆抗体研究有关的论文开展主题分析。结果：美国在单克隆抗体研究领域科研论文的数量和质量遥遥领先；大学是单克隆抗体领域科研的主力军。结论：美国等发达国家在国际单克隆抗体研究中占据主导地位，中国近10年虽然发展迅速，但与发达国家相比还有较大差距。关键词：单克隆抗体;信息可视化;文献计量分析;聚类分析;共词分析ALiteratureAnalysisinInternationalMonoclonalAntibodyResearchLiHaicun,WangMin,XuPeiyangInistituteofmedicalinformation,PekingUnionmedicalcollege,100020Abstract:Objective:Theaimofthestudyistocomparethecontributionofdifferentworldregionsandinstitutesinmonoclonalantibodyresearchproductivity,anddiscoverthemainsubjectsandhottopicsinmonoclonalantibodyfield.Methods:Thearticlesonmonoclonalantibodyweresearchedinwebofsciencedatabase(SCIE),basedonbibliometricmethod,variousfieldslikepublicationyear,countryofpublications,journalsandinstituteswereanalyzedexhaustively;Adetailedanalysisonthemainsubjectsandtopicswereanalyzedbyusingco-wordanalysis,clusteranalysisandvisualizationanalysis.Results:TheresearchersinUSApublishedalargenumberofhighqualitypapers,anduniversitiesplayanimportantroleinthisfield.Conclusion:thedevelopedcountriesespeciallyUSAplayadominantroleinthisfield.Chinahasmadeagreatprogressinrecenttenyears,butstilllaggedbehindthedevelopedcountries.Keywords:monoclonalantibody;informationvisualization;bibliometrics;clusteranalysis;co-wordanalysis《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020)》将提高自主创新能力作1中国医学科学院医学信息研究所中央级公益性基本科研业务费专项资助.课题名称:信息可视化在医学信息分析中的应用研究(编号CR2009029)为国家长期战略，并把生物技术作为未来重点发展的前沿技术[1]。《国家“十一五”科学技术发展规划》选择生物和医药技术等领域作为超前部署的重点，计划实施疫苗与抗体工程等重大项目[2]。国家在抗体药物领域投入巨大，而抗体药物等生物医药产品具有研发周期长、高投入、高技术、竞争激烈、高风险、潜在的法律责任大等特点[3]，因此把握单克隆抗体的主要研究领域、主要技术和发展趋势等对我国单克隆抗体领域的科研发展十分重要。本文单克隆抗体研究文献分析主要包括两大部分：一是采用基于数量统计的文献计量学方法，对WebofScience(SCIE)收录的单克隆抗体论文的时间、国家、机构、期刊进行分析，了解单克隆抗体研究的时间、期刊、国家和机构分布；二是综合运用共词分析、聚类分析和可视化分析方法，对单克隆抗体研究有关的论文开展主题分析，并对结果进行可视化展示，更加准确、直观地揭示单克隆抗体研究的主要领域、研究热点等。1.资料来源和方法1.1资料来源本文主要采用ThomsonReuters科技信息集团ISIWebofScience数据库作为检索对象（即SCIE收录文献），检索时间范围是1999-2008年，数据库更新时间截止到2009年11月22日。1.2方法首先在PubMed、Embase数据库中对单克隆抗体进行预检索，抽取题名、关键词和摘要中抽取的相关主题概念，同时参考这两个数据库中与单克隆抗体有关的主题词，从而确定单克隆抗体的检索策略（详见附录）。在WebofScience（SCIE）数据库中，采用一般检索方式，将制定的检索策略在题名/主题中进行检索，出版时间限定为1999-2008年，文献类型限定为Article和Review，检索结果为50357篇（检索时间为2009-11-22）。采用基于数量统计的文献计量分析方法，利用ThomsonDataAnalysis（以下简称TDA）[4]。对单克隆研究论文的时间分布、国别分布、机构分布、期刊分布进行分析。在文献分析中，数据分析的准确性是影响分析的一个重要因素，由于数据地址字段不规范，因此在开展数据分析前，首先利用TDA清洗功能，对地址中的国家、机构等字段进行规范。此外，本文的国家和机构分布仅对第一作者所在的国家、机构进行分析。2.统计与分析2.1单克隆抗体研究文献的时间趋势1999-2008年10年间，WebofScience数据库共收录单克隆抗体文献50357篇。前期文献调研显示，单克隆抗体的研究于上世纪90年代中期达到高峰[5]。对1999-2008年国际单克隆抗体研究文献分析显示（见图1），1999-2008年每年文献量变化不大，未出现增长现象，甚至在2001-2006年出现文献回落现象。中国单克隆抗体文献量从1999年的51篇增长到2008年的273篇，增长速度较快，但总量亟待提高，2008年中国的单克隆抗体研究的文献量不足全球的5%。553252264946476646074700476849535311554851596064777313318223327301000200030004000500060001999200020012002200320042005200620072008总文献量中国图11999-2008年WebofScience数据库收录的单克隆抗体文献时间分布2.2单克隆抗体研究文献的国家/地区分布与合作对国际单克隆抗体研究发表文献所在的国家/地区进行分析显示（见表1），美国发文量高居首位，10年共发表17520篇，占全部文献量的34.79%，其次分别为日本、德国、英国、法国、意大利、荷兰、加拿大和中国等，但各国均未超过全部文献量的10%，其中中国发文量为1205篇，占全部文献量的2.39%。美国发表的17520篇单克隆抗体研究文献的总被引频次为482396，占全部文献被引频次的46.43%，遥遥领先于其他国家，其篇均被引也高达27.53次/篇。在总被引频次排名前10的国家中，英国、荷兰、德国和法国等国的篇均被引频次也较高。中国的篇均被引频次较低，为4.85次/篇，远低于全球文献篇均被引频次，说明中国的单克隆抗体研究水平有待进一步提高。利用TDA软件，采用国家-国家共现分析方法，对发表单克隆抗体论文的前40个国家（发文量大于100篇，文献量占总文献量的96.85%）进行分析，生成国际单克隆抗体研究国家合作网络图谱（见图2）。美国是单克隆抗体研究的核心主体，英国、荷兰、德国、加拿大等发达国家与其开展科研合作较多，发展中国家巴西、墨西哥与美国的科研合作也很紧密。表11999-2008年WebofScience数据库收录的单克隆抗体文献发文量前10个国家序号国家文献量所占比例（%）被引次数篇均被引次数1USA1752034.7948239627.532Japan48879.706306312.903Germany37357.427231919.364UK33166.588988627.115France24134.794754019.706Italy21354.243846918.027Netherlands15273.033553723.278Canada14712.922822319.199China12052.3958394.8510Australia11382.262067318.17Cross-CorrelationMapCountries(1)(top)Countries(1)(top)Toplinksshown0.750(0)0.50-0.750(0)0.25-0.5012(0)0.2524(744)TurkeyTurkeyThailandThailandTaiwanTaiwanSwitzerlandSwitzerlandSwedenSwedenSpainSpainSouthKoreaSouthKoreaSouthAfricaSouthAfricaSlovakiaSlovakiaSingaporeSingaporeRussiaRussiaPortugalPortugalPolandPolandChinaChinaNorwayNorwayNewZealandNewZealandNetherlandsNetherlandsMexicoMexicoJapanJapanItalyItalyIsraelIsraelIrelandIrelandIndiaIndiaHungaryHungaryGreeceGreeceGermanyGermanyFranceFranceFinlandFinlandUKUKDenmarkDenmarkCzechRepublicCzechRepublicCubaCubaChileChileCanadaCanadaBrazilBrazilBelgiumBelgiumAustriaAustriaAustraliaAustraliaArgentinaArgentinaUSAUSA图21999-2008年WebofScience数据库收录的单克隆抗体文献的国家/地区合作网络2.3单克隆抗体研究文献的机构分布对国际单克隆抗体研究发表文献所在的机构进行分析显示（见表2），发文量前10的机构中，有8个分布在美国，显示出美国在单克隆抗体研究方面的雄厚实力。值得注意的是进入前10名的机构中有9个为大学，说明大学是单克隆抗体研究领域开展基础研发的主力军。表21999-2008年WebofScience数据库收录的单克隆抗体文献机构分布序号机构国家文献量被引次数篇均被引次数1UnivTexasUSA7582718835.872HarvardUnivUSA4751774137.353UCLUK4201316831.354NCIUSA3611343237.215WashingtonUnivUSA3391258737.136UnivPennUSA3321009230.407UnivMunichGermany309872628.248MemSloanKetteringCancCtrUSA2711119341.309UnivCalifLosAngelesUSA2681322449.3410MayoClin&MayoFdnUSA2541059141.702.4单克隆抗体研究的期刊分布对国际单克隆抗体研究发表文献所在的期刊进行分析显示（见表3），载文量位居前10的期刊共载文6079篇，占总文献量的12.03