PubMed检索文献的技巧与方法

1PubMed2PubMed系统PubMed系统是由美国国立医学图书馆附属美国国立生物技术信息中心NationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统。网址为：http：//美国生物技术信息中心(NCBI)网上检索系统的网页。4PubMed检索系统•一、PubMed检索系统数据来源包括：1、MEDLINE2、PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库，其数据经过标引和加工，每周向MEDLINE移加一次。PreMEDLINE的记录有[PreMED—inprocess]的标识。3、RecordsuppliedbyPublisher出版商提供而未被MEDLINE、PreMEDLINE收录的数据。5二、检索原理•1、具有自动转换匹配功能（AutomationTermmapping）对输入检索框中的检索式，PudMed将与它的四个索引进行对照、匹配和转换，然后进行检索。•（1）输入的是关键词，系统会找出与之对应的Mesh词，以文本词（关键词）与Mesh词同时进行检索。例如输入taxol，系统转换为（“paclitaxel”）[MeshTerms]OR“taxol”[TextWord]•（2）如果输入的是多个词，系统未能在四个索引中找到与之一致的词组形式，会自动将每一个词用“AND”联接起来进行检索。如taxollungcancer系统转换成：•(((“paclitaxel”[MeshTerms]ORtaxol[TextWord]AND(“lungneoplams”)[MeshTerms]ORlungcancer[TextWord]))ANDnotpubref[sb])子文档6•（3）如果不愿意对提问词进行转换，可以用“”双引号加以限制。如“paclitaxelANDlungneoplasms”•匹配用的四个索引按顺序是：•MeshTranslationTable（Mesh转换表）•JournalsTranslationTable（刊名转换表）•PhraseList（短语列表）•AuthorIndex（著者索引）•2、自动扩展检索功能，如果没有说明系统会对主题词、副主题词进行扩展检索。如果不扩展可用标识符“noexp”。•“hypertension/therapy[mh：noexp]”7•3、短语检索（PhraseSearching）也可称为强迫词组检索，即，将短语用双引号“”引起来，作为一个词组检索。如“singlecell”，作为一个词组检索，系统不进行自动转换匹配,也不进行Mesh词的扩检。•4、支持布尔逻辑符AND、OR、NOT和截词*的使用。逻辑符用大写。在采用多个逻辑符表达的检索式中，括号（）内的检索式优先运行。8三、检索方法基本检索、辅助检索、其他检索•（一）基本检索•在检索框中可输入任何具有实质性意义的词，系统将进行自动匹配。点击检索框边的“GO”按扭，即可执行检索。•著者：姓在前，名在后。•刊名可输入全称；或MEDLINE认可的标准缩写形式；以及ISSN。•输入逻辑符号、及截词符（*）•举例如下：9输入选择PUBMED检索界面。10例1：在框内可输入任何有实质意义的词，系统将进行自动匹配。还可输入逻辑符号（大写）、及截词符（*）。输入lungANDsmok*点击“ＧＯ”11lungcancerANDsmok*点击“ＧＯ”,检索结果9254篇12选择Medline格式，点击disply，显示检索结果。13例2：允许用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。输入“singlecell”，点击GO按扭。14用“Singlecell”检索的结果181861篇。15（二）辅助检索•辅助检索栏又称特征栏（FeaturesBar）,位于检索框下面。包括四种功能：Limites条件限定；Preview/Index预览/索引；History检索史；Clipboard粘贴板；•１、Limites“条件限定”•相当于PubMed的高级检索界面。除基本检索以外，还以下拉菜单的形式提供对某些检索字段的限制，如：年龄、性别、人或动物、语种、文献类型、出版年份以及子集数据库（包括MEDLINE，PREMEDILE，PUBLISHER和AIDS数据库）的限定。16点击“条件限定”（Limits）。系统进入高级检索界面，显示多种限定条件供选择。17•限定条件如：•AllFields•Onlyitemswithabstracts•PublicationTypes•Ages•Languages•Subsets三个数据库和AIDS•HumanorAnimal•Gender：male、female•EntrezDate：PubMed收录数据的日期。•PublicationDate18Limits的下拉菜单19例：查找近两年有关字宫内膜异位症的综述文献。点击limits按扭，在检索框输入endometriosis，在limitedto的publicationtype中选择review，在entrez中选择2years。点击“GO”。20检索结果，近2年有关子宫内膜异位症的综述文献有233篇。212、Preview/index预览/索引•在预检索界面可执行以下功能：•（1）、在显示检索结果前先显示检索结果的记录数量（Result）。在检索框内输入检索式，点击preview按钮，将会显示检索结果的篇数。点击记录数的链接，系统显示当前检索策略的检索结果。•（2）、加词检索：如对检索结果不满意，可在原有检索式的基础上加词检索。在下面的加词检索框输入检索词及逻辑符，点击Preview。•（3）、特定字段加词检索。如对所加词的字段有特殊要求，可在预检索界面左下方下拉菜单中进行选择。•（4）、Index功能，在加词检索框中输入若干个字母，在左下边的下拉菜单中选择该词所在的字段，点击最右边的Index按扭，系统就会显示该字段中以这几个字目开头所有的词、词组，可选择，点击preview按钮进行预检。如aspirin，title字段。（见后图）22例1：点击特征栏Preview/Index按扭，进入预览/索引功能界面,检索框右侧增加了Preview按扭。在检索框输入检索式，点击Preview按扭，显示检索结果的数量。23检索界面的下面有加词检索框及Index按扭，又称预检索界面。左下面默认Allfield框，有特定字段选择。24例2：婴幼儿巨细胞病毒感染与听力损伤。（1）、点击Preview/index，进入预览/索引界面。在检索框内输入cytomegalovirus，点击Preview按扭，系统返回检索序号1，共26627条记录。25（2）删除第一次输入的检索式，在检索框内键入Hearingloss，点击Preview按扭。系统返回检索序号2，共37873条记录。26（3）删除第二次输入的检索式，在检索框内键入infants，点击Preview按扭。系统返回检索序号3，共645790条记录。27（4）在检索框内输入#1AND#2AND#3的检索结果为122条。28加词检索：在加词检索框输入的检索词可通过左下角的AllFields的下拉菜单进行限制。29Index：从索引表中选词检索。例如aspirin，在AllFields选title字段，点击Index按钮，系统显示aspirin的索引词表。每词按字顺排列，词后数字为纪录数，可选其中的词进行检索。30•3、History检索史；主要用于查看检索策略，查看检索结果；并可用已有的检索式来编制检索策略。可存储100条检索式。•4、Clipboard剪贴板；可容纳500条记录。将检索的结果存入到剪贴板中，主要便于集中显示、下载。31结果显示•点击GO以后，系统将自动进行检索。在结果显示屏中，会显示当前检索式、检出文献总篇数等信息。并有disply、show、sendto等按扭，可对检索进行操作。（见后图）321、结果显示（disply）：在显示结果屏中，有检索式、文献总篇数，并有show、sendto等按扭。33（1）选择显示格式Display按钮右边有下拉式菜单，可提供选择显示格式，如文摘、引文格式等待，其中Medline格式最为完整。34例：lungcancerANDsmok*的检索结果显示。先在下拉菜单中选择显示格式，然后点击Display按扭。35（2）Details：点击Details按扭，显示经PubMed自动匹配转换后的检索策略。如lungcancerANDsmok*一例，可以修改后，按Search按钮重新检索。36（3）Sendtoclipboard，给选中的文献前的小方框打钩，选择clipboard，点击Sendto按扭。37点击clipboard按扭，选中的两篇文献已在其中。38（三）其他检索•1、主题词数据库检索（MeshDatabase）。相当于medline光盘的theasaus命令。使用该功能可选择规范化主题词、副主题词、查看词义注释、浏览树状结构表等，可执行主题词检索，可以提高检索效率。点击PubMed界面左边的MeshDatabase按扭，进入主题词检索界面。在MeshDatabase的检索框中，输入检索词，如果不是Mesh词，系统将提供同义词或近义词Mesh给于选择，同时显示Mesh树。39点击MeshDatabase按扭，进入主题词检索界面。40例：主题词检索界面的输入框内输入livercancer，点击GO按扭，系统提示livercancer不是Mesh词，规范主题词应该是liverneoplasms。41点击主题词liverneoplasms，显示副主题词，可供选择。42系统同时还显示检索的限定。如主要主题词限定；限制下位词扩检。43系统同时还显示其树状结构表。44用liverneoplasms选择副主题词radiotherapy、therapy，点击GO按扭，出现searchPudMed按扭，及检索策略。（见后页）45点击searchPudMed按扭。系统把检索词转PudMed检索系统自动进行检索。46检索结果448篇，题名左边书的符号为文摘，点击即可。47MeSHBrwser：•MeSHBrwser：可用于查找某自由词的MeSH专业主题词和主题检索。•在MeSH字段，输入任意词，如cancer，点击GO，系统显示neoplasms为主题词。点击（红色）的主题词。48点击主题词neoplasms将出现NLMMeSHBrwser按钮。49点击主题词neoplasms，系统出现NLMMeSHBrwser按钮。50点击NLMMeSHBrwser按钮。系统出现MedicalSubjectHeadings检索界面。51在输入框内输入neoplasms，点击findexactterm按钮，系统出现MedicalSubjectHeadings、Seealso和MeSHTreeStructures。52MedicalSubjectHeadings53参照系统54MeSHTreeStructures55可以按分类逐级选择合适的主题词5657582、期刊数据库。•点击PubMed左面的Journalsdata按扭。系统转到期刊数据库首页界面。•期刊数据库，可通过刊名全称、刊名简称[Medline缩写格式]、ISSN号、刊名中的单个或若干个词来查找特定的期刊。•点击界面中部的Journalswithlinksfull-textwebsite将列出与PubMed有全文链接的期刊刊名，按字顺排列。可查找期刊中的文献。59点击Journalsdata按扭，进入期刊数据库首页界面。点击界面中部的Journalswithlinksfull-textwebsite将列出与PubMed有全文链接的期刊刊名。60如输入的刊名与Mesh词表的主题词相同，需要用刊名字段标认识符[ta]加以限定。“Science