vector-nti-11--使用教程---第二章-资料库建立和储存序列

第二章数据库建立和储存序列5第二章　数据库建立和储存序列　在了解主程序的样子之后，接下来必须要先了解NTI的数据是如何储存和读取，并且建立自己的序列数据库。在NTI的程序中会有一个内建好的数据库，同时把存盘的路径预先设定在数据库的位置之中。我们自身主机的数据库叫做LocalDatabase，同时NTI提供了数据库分享的功能，可以透过网络和其他主机交换或分享序列数据。　如何建立自己的数据库？首先在主程序下点选（LocalDatabase）开启数据库，为分享和交换数据库的指令。LocalDatabase开启后会看到下面图示(图2.1)：图2.1使用LocalDatabase开启数据库　进入数据库后会先看到右手边的窗口有一大堆数据，那是程序事先内建好的序列数据，可以直接点选开启。数据库会因为序列的性质不同而有不同的归类，想要看不同的类别可以在左上角选择。VectorNTI教育及训练手册6图2.2建立数据库　接下来要建立属于自己的数据库了，以斑马鱼的基因序列为例，第一步在DNA/RNAMolecules(图2.2)的项目下点选后会在Invitrogenvectors下方出现一个Group1的文件夹，可以自己改名。在新的文件夹项目下再点选，会跳出一个窗口(图2.3)：图2.3新建数据库　旁边的字段可以输入名称，接着点选DNA/RNAMolecule(图2.4)：第二章数据库建立和储存序列7图2.4新的DNA/RNA模块　　　在此项目下可以选择序列的特性，这些项目的选择会影响到主程序的分析和图谱形状，可以依照序列的特性设定。　接着再点选SequencesandMaps:图2.5编辑斑马鱼海大基因的序列　在此窗口(图2.5)下，我们就将要加载的序列先全选后再按复制，之后在这窗口下点选Paste后就可以贴入序列。VectorNTI教育及训练手册8图2.6贴上斑马鱼海大基因序列　接着按OK后再按确定(图2.6)，如此便建立好我们的序列数据了。之后要开启此数据时，只要进入LocalDatabase后，在自己建立的文件夹下连续点两下该文件名就可以直接开启。NOTE：上一章提到剪贴方式加载序列的方法和上面相同，只是要从主程序中左上角的File→CreateNewSequence→UsingSequenceEditor(DNA/RNA)orUsingSequenceEditor(Protein)。从这条路径一样可以建立序列资料，但是存盘时会存在内建好的Database中。存档：我们把序列加载主程序后要如何储存？NTI已经默认档案储存路径是指向LocalDatabase，只要按下就可以存盘。除此之外，当我们把程序关闭时，程序也会自动帮我们进行自动储存的动作，可以避免我们忘记储存的疏忽。一般来说档案存在LocalDatabase的文件夹内是很安全，但是为了以防万一，在此强烈建议再存一个备份文件：在File项目下选择Saveas后就可以选择我们想要储存的文件夹位置。欲开启储存的档案只要连续点两下就可以直接打开。