外文医学文献检索工具PubmedSCI

外文生物医学文献检索工具的使用技巧与策略——Pubmed与SCI主要内容一.PUBMED二.SCI一.PUBMED1、PUBMED简介2、PUBMED的基本检索功能3、PUBMED的高级检索功能4、PUBMED的结果的处理1.1什么是Pubmed？1.2Pubmed的发展过程1.3Pubmed的收录范围1.4Pubmed的记录来源1.5Pubmed的常用字段1.6Pubmed检索的特点1.7Pubmed界面1、PUBMED简介创建机构：美国国立医学图书馆（NLM）下设的美国生物技术信息中心（NCBI）摘要型(Abstract)的数据库,提供文献的线索特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、检索体系完备、文摘库、部分文献可以免费获得全文整合在NCBI的统一检索平台Entrez上，与该平台其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索1.1什么是PubMed？1.2PubMed的发展历程1997-1983-1971-1879-PubMed网络数据库Medline光盘数据库Medline联机检索系统IndexMedlcus（IM）检索期刊收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题录数据，涉及40多个语种English4806（约占85%)Chinese69FrenchJapanese……绝大部分可回溯至1948年，最早回溯至1865年内容涉及基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域1.3PubMed的收录范围期刊论文发表时所用的语言部分文献可直接获取全文，包括PubmedCentral（PMC，收录期刊780余种）；NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库开放获取（OpenAcess，OA）期刊部分出版商提供的免费文献1.3PubMed的收录范围MEDLINEIndexed1966年以来的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，标记：[PubMed-indexedforMEDLINE]1.4PubMed的记录来源OLDMEDLINE1948-1965年间发表的200万篇生物医学文献未标引，无MeSH字段，标记：[PubMed-OLDMEDLINE]1.4PubMed的记录来源MEDLINEInprocess由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未标引的数据只有简单的书目及文摘信息，无MeSH字段标引后，获得MeSH词后，再加入MEDLINEIndexed标记：[PubMed-inprocess]1.4PubMed的记录来源Publisher-Supplied出版商提供的电子文献题录包括MEDLINE未收录的部分记录标记：[PubMed-assuppliedbypublisher]1.4PubMed的记录来源1.5PubMed的常用字段•PubMed中供显示和限定检索用的字段共有60多个字段标识字段名称说明ABAbstract摘要ADAffiliation第一著者的单位和地址（包括E-mail地址）AUAuthorName著者CIUCommentin该字段中的文献评论了本文献CNCorporateAuthor合著者或团体著者CONCommenton该字段中的文献是本文献的评论对象DPPublicationDate出版日期GRGrantNumber经费资助项目号、合同号IPIssue期刊的期号ISISSN国际标准连续出版物编号LALanguage语种MAJRMeSHMajorTopic主要MeSH词，即有*的主题词MHMeSHTermsMeSH词（主题词）NMSubstanceName化学物质名称OTOtherTerm非MeSH词，NLM之外的机构赋予的关键词1.5PubMed的常用字段字段标识字段名称说明PGPagination文章所在期刊的页码PMIDPubMedUniqueIdentifierPubMed记录识别号PLPlaceofPublication期刊出版地PSPersonalNameasSubject作为文献主题的人名PTPublicationType文献类型，包括期刊论文、综述、临床试验、随机对照试验、病例报告、来信等SHMeSHSubheadingsMeSH副主题词SOSource文献出处TAJournalTitleAbbreviation刊名缩写TITitle篇名TIABTitle/Abstract不用于显示。用于对篇名和摘要字段进行检索TWTextWords不用于显示。用于以下字段的检索：TI、AB、MH、SH、NM、PS、OT等字段VIVolume期刊卷号•系统特点：主题加工规范检索方式灵活多样免费提供题录和文摘提供与原文的网址链接(部分免费获取）提供检索词自动转换匹配1.6PubMed的检索特点检索词输入框使用帮助常用工具更多服务1.7PubMed界面PubMed题录作者AU题名TI来源SOPubMed记录类型（状态）2.1自动词语匹配检索2.2著者检索2.3期刊检索2.4短语精确检索2.5截词检索2.6布尔逻辑检索2.7限定检索2.8日期或日期范围检索2、PUBMED基本检索功能输入有实际意义的检索词，点击“Search”，系统按照自动词语匹配的原理进行检索Pubmed最具特色的检索功能之一智能化的检索过程基本原理：对输入的检索词，首先在多个索引词表进行搜索、比对，并自动转换为相应的MeSH主题词、著者或刊名，再将检索词在allfields（所有字段）中检索，并执行“OR”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组，则继续将其拆分为单词后分别在allfields中检索，单词之间的逻辑关系为“AND”2.1自动词语匹配检索SearchDetails框详细显示自动词语匹配的实际检索有较好的查全率，同时保证一定的查准率例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文献，最简单的方法是在检索框中直接输入Heartattackaspirin三个词2.1自动词语匹配检索转换后的检索式可进行修改三种方法：一.在检索框中输入著者姓名，Pubmed自动执行著者检索一般姓在前名在后，姓用全称，名用首字母例如，输入SmithSR可检索出姓为Smith，名的首字母为SR的所有著者的文献2002年以后的文献，Pubmed可实现对姓名全称的检索，而且姓名排列顺序不限例如，输入SmithSR的姓名全称StevenRSmith，可检索出2002年以来该著者被Pubmed收录的文献。2.2著者检索二.通过字段限定检索及组合检索也可实现更精确的著者检索例如，输入SmithSR[1AU]可检索出第一著者为SmithSR的文献三.通过“Advanced”中的“Author”限定，可以检索该作者的文献2.2著者检索四种方法：一.利用PubMed自动词语匹配功能，其输入规则是：期刊全名、MEDLINE期刊缩写名、ISSN号（例如1671-3982）三种形式中的任何一种形式均可。例如：CancerRES。如果期刊刊名正好与MeSH词相同，例如cell、science等，PubMed将这些词作为MeSH词检索。2.3期刊检索二是利用期刊字段限定检索，其输入规则是：在刊名之后加上刊名字段符。例如：CancerRES[TA]。三是通过“Advanced”中的“Journal”，可以检索该刊发表的文献。四是通过“JournalsinNCBIDatabases”，查找到该刊后，再选定该刊，发送到检索框进行期刊检索。2.3期刊检索2.4短语精确检索对检索词加上双引号（英文状态）进行强制检索短语精确精确检索时，Pubmed关闭自动词语匹配功能例如：检索框中输入“traditionalChinesemedicine”，PubMed将“traditionalChinesemedicine”作为一个不可分割的短语在数据库的所有可检索字段中进行检索。2.4短语精确检索2.4短语精确检索结果对比Traditionalchinesemedicine“Traditionalchinesemedicine”2.5截词检索在检索词后加“*”可实现截词检索，以提高查全率，对词根或词尾略有变化的词进行检索时需要应用截词检索。截词检索时，Pubmed关闭自动词语匹配功能，PubMed允许使用“*”进行右边截词检索。如：“viru*”，检索以viru开头的单词，immun*，可以检出immune、immunologic等词。如果单词数量大于600，则PubMed自动提示延长词干。截词功能只限于单词，对词组无效。2.6布尔逻辑检索逻辑运算符号主要有“AND”、“OR”、“NOT”，分别表示“逻辑与”，“逻辑或”，“逻辑非”。AANDBAORBANOTB2.6布尔逻辑检索•直接输入几个检索词，系统默认词之间是AND的逻辑组配关系•逻辑运算符号的顺序为从左至右，可以用全括号来改变其运算顺序。2.7限定检索•限定检索功能是对上一次检索操作结果进行限定。•限定检索将限定在MEDLINE数据库中进行。限定检索结束后，需要将限定取消，点击“Clearall”。•选择条件就是点击选中限定选项。•PubMed可限定内容包括：字段、文献类型、语种、日期、子集（Subsets）限定等。2.8日期或日期范围检索•可以在检索框中键入日期或日期范围，系统会按日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。•日期的录入格式为YYYY/MM/DD[DP],可以只写年如：1999/09/08[DP]:出版日期为1999年9月08•日期范围用冒号链接如：2004/01:2004/06[DP]•日期字段有三个[DP]、[EDAT]、[MHDA]3.1检索史3.2组合检索3.3主题词检索3.4期刊数据库检索3.5其他检索服务3、PUBMED高级检索功能3.1检索史SearchHistory检索史，包括检索式序号、检索提问式、检索时间及检索结果数单击检索式序号，显示Options选项，可执行AND、OR、NOT、Delete（删除检索式）、SaveinmyNCBI（把检索式保存在MyNCBI）等不同操作检索史最多保留8小时3.2组合检索•组合检索可实现多个字段的逻辑组配检索•在之前的检索基础上可以序号形式参与运算。如：#1AND#2、#3OR#4等。3.3MESH主题词检索•PubMed记录中的医学主题词(MeSH,MedicalSubjectHeadings)是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指定的词，主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词•用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献–不同拼写：leukemia(s),leukaemia(s)→leukemia–同义词：cancer(s),tumor(s),tumour(s),neoplasm(s)→neoplasms3.3MESH主题词检索一篇文章可有多个MeSH词主题词可以组配相应的副主题词主题词的树状结构表：系统默认对含有下位概念的主题词进行扩展检索注意：MeSH主题词检索，只检索来源于MEDLINE的文献，不检索PubMed其他来源的文献(suppliedbypublisher)，且未经MeSH主题词标引的文献检索不到(inprocess、OLDMEDLINE)SubHeadings副主题词副主题词（subheadings）是用于对主题词做进一步限定的词语。如某一疾病的诊断、治疗，某种药物的毒性、副作用等。目前有83个副主题词并非每个主题词都能和83个副主题词组配。二.PUBMED使用指南主题词（MeSH）检索的具体方法和步骤如下：副主题词主要主题词（加权）扩展检索树状结构二.PUBMED使用指南检索结果：主题词检索注意问题①当课题含有多个主题词时，在MeSHDatabase中的操作往往需要重复多次。②进入到主题词细节页面时，要多注意主题词的上位词和下位词情况，看看是否