KEGG上的信号通路图怎么看

KEGG上的信号通路图怎么看？提示：请点击标题下方蓝色“实验万事屋”，添加关注后，发“嗯”可以查看我们之前的文章。未经允许，其他公众号不得转载哦！想要把自己研究的分子扯上明星分子或者明星通路？那是不难，难的是具体到底要怎么去扯，芯片结果啊，生信结果啊，都会给你提示，但真的要具体扯上去，还得看懂那些七七八八的信号通路图。KEGGPathway上有着大量的信号通路图，画得一个复杂啊！巨坑爹有没有？曾经有师弟说我之前曾经把Wnt通路描述错了，他师兄告诉他，应该是GSK-3β磷酸化抑制β-Catenin降解，并促进它入核的。在这里，我们只能默默地祝福这位师兄了……那我们就用Wnt通路来做例子吧。先上KEGG下载一个Wnt的信号通路图，如下：绝壁是很高大上的不是么？这要咋看呢？其实这张图上把三个Wnt通路都画上去了，也就是Wnt/β-Catenin（经典Wnt通路），Wnt/PCP（平面的细胞极性途径）和Wnt/Ca2+（Wnt/钙离子）三条信号通路组成，我们就删减一下，就光看经典的Wnt通路，就变成了下面这个模样：感觉还是很高大上有木有？那就再删减一下，把它变成经典Wnt信号通路的骨架会是什么样呢？就是这样：简洁明快了吧，但要怎么来看懂这样的图呢？我们来看一下KEGGPathway的具体图例：把这些图例用来解释经典Wnt信号通路骨架图，就变成了：看懂了么？那给你从左到右解释一下：1）Wnt激活膜上受体，将信号传递到第二信使Dvl，活化的Dvl抑制由Axin、APC和GSK-3β组成的复合物的活性,使β-catenin不能被GSK-3β磷酸化。2）磷酸化的β-catenin才可通过泛素化(ubiquitination)而被胞浆内的蛋白酶体所降解，由于非磷酸化的β-catenin不能被蛋白酶体降解，从而导致β-catenin在胞浆内积聚，并移向核内。3）当游离的β-catenin进入细胞核内，即可与转录因子TCF/LEF结合，激活TCF转录活性，调节靶基因的表达。那我们回过来看复杂一点的图上都讲了啥？(看不清可以点击图片即可放大）这个就是整个经典Wnt信号通路的调控机制了。我说看帖的你，明白KEGG的信号通路该怎么看了吧！要是已经明白了的话，是不是应该拿去教育教育你师兄，别把师弟师妹带坏了呢？