Medip-seq甲基化测序分析流程

#流程大放送#MeDIP-seq测序知音无限介绍MeDIP-Seq全称MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，即甲基化DNA免疫共沉淀测序。该种测序方法通过使用5'-甲基胞嘧啶抗体特异性抓去样本中甲基化程度高的DNA片段，并对富集的DNA片段进行高通量测序。相对于BS-seq和RRBS-seq技术而言，MeDIP-seq技术以较小的数据量和较高的性价比，帮助科研人员检测基因组上的甲基化区域。需要注意的是，MeDIP-seq生成DNA甲基化图谱最小分辨率在50-100bp左右，无法达到BS-seq和RRBS-seq的单碱基分辨率。该项技术可用于以下研究1、处于特定时期或特定处理条件下的样本中，研究样本中染色体DNA甲基化模式；2、比较不同细胞、组织、样本间的DNA甲基化修饰模式的差异。3、疾病样本中，与疾病发生发展相关的DNA甲基化表观数据处理和分析流程图示例图片展示示例图2DNA甲基化信号在不同类型染色体区域的分布示例图2特定基因区域内甲基化信号展示[1]示例图3基因TSS位点周围甲基化信号分布特征分类[1]图片来源文献[1].Kim,J.H.,etal.,DeepsequencingrevealsdistinctpatternsofDNAmethylationinprostatecancer.GenomeRes,2011.21(7):p.1028-41.