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端粒长度检测方法:实时荧光定量PCR分两部分进行,分别测定端粒和内参基因RPLPO(核糖体大亚基PO蛋白基因)的Ct值,每次反应需要设定标准曲线。端粒(T)重复拷贝数与单拷贝基因(S)的比率,即T/S比率可以得出端粒的相对长度,而T/S比率与端粒长度成正比关系。T/S计算公式如下:T/S=[2CT(telomeres)/2CT(singlecopygene)]=2-ΔCT1基因组DNA的提取1.提取人外周血基因组DNA以试剂盒提取获得人外周血基因组DNA。2实时荧光定量PCR测定DNA端粒长度1.引物序列端粒Tel1:浓度675nmol/L序列5’-GGTTTTTGAGGGTGAGGGTGAGGGTGAGGGTGAGGGT-3’端粒Tel2:浓度1350nmol/L序列5’-TCCCGACTATCCCTATCCCTATCCCTATCCCTATCCCTA-3’RPLPO基因hRPLPO1:浓度800nmol/L序列5’-CCCATTCTATCATCAACGGGTACAA-3’RPLPO基因hRPLPO2:浓度800nmol/L序列5’-CAGCAAGTGG-GAAGGTGTAATCC-3’2.标准曲线制作选取同一血样基因组DNA为标准品,使用等比稀释,稀释系数为2,浓度范围为:0.25-64ng/μl,即可稀释得9个浓度梯度,分别为64,32,16,8,4,2,1,0.5,0.25ng/μl,制作的标准曲线R20.98。3.反应体系(每个样设置品三个重复)10μl反应体系gDNA10ngMasterMix(quantiTectSyberGreenPCRkit)Upto10μl注:内参及样品反应体系中,MasterMix除了引物不同外,其余成分均相同另一文献所述的反应体系25μl反应体系SYBRPremixExTaq(2X)12.5μlgDNA1.0μl(约60ng/μl)端粒Tel1(内参基因hRPLPO1)0.625μl(1μl)端粒Tel2(内参基因hRPLPO2)2.25μl(1μl)dH2OUpto25μl4.PCR反应条件95℃10min95℃15sec54℃2min54℃检测荧光强度,35个循环72℃10min参考文献:[1]SoniaGarcı´a-Calzo´n,AdrianaMoleres,Ascensio´nMarcosetal.TelomereLengthasaBiomarkerforAdiposityChangesafteraMultidisciplinaryInterventioninOverweight/ObeseAdolescents:TheEVASYONStudy[2]吕昆,林丹,许淼等.应用实时荧光定量PCR测定牛体细胞端粒长度[3]王敏敏,杨浩,刘广义等.荧光定量PCR测定端粒长度
本文标题:端粒长度检测方法
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