华中农业大学生物信息学课件Bioinf00

谢为博Tel：87280350Email:[e-mail]2016年04月生物信息学Bioinformatics•生命科学相关专业的本科生–考研–毕业设计–工作•生命科学相关专业的研究生–课题研究适用者了解、掌握和利用Internet上各种生物数据库、软件何处查找所需各种生物数据信息如何分析和解释所得数据信息学习本课程的目的SequenceanalysisGenomeannotationAnalysisofgeneexpressionAnalysisofregulationPredictionofproteinstructureComparativegenomics1.生物信息学学科的发展和研究内容2.生物数据库3.关键词或词组为基础的数据库检索4.核酸和蛋白质序列为基础的数据库检索5.多序列对位排列分析和系谱分析6.基因预测和基因结构分析7.蛋白质性质和结构分析8.农业类及物种专属数据库的利用9.核酸序列的其他分析方法10.芯片表达谱基本分析及查询课程组成数据库介绍及检索（2,3,4,8）DNA/RNA序列实验两序列比对及blast检索（4）多序列比对及系谱分析（5）基因预测（6）表达谱（10）核酸序列的其他分析（9）蛋白质性质及结构分析（7）基因功能预测及分析设计芯片本课程各章的关系华农主页－南湖教苑－精品课程－国家精品课程－2007年国家精品课程－生物信息学教学网站获取课件及自学资源•最新课件（只能校内访问）用户名：weiboxie密码：2016或•中国大学资源共享课（包括1-9章课堂视频及大部分练习）•华中农业大学生物信息学课程维基（包含大量数据库介绍）•QQ群=1027&k=2IQT8oV参考教材DavidW.Mount.Bioinformatics:SequenceandGenomeAnalysis.(2ndedition)NewYork:ColdSpringHarborLaboratoryPress,2004.李霞等，生物信息学，人民卫生出版社，2010。参考教材陈铭等译，精要速览系列-生物信息学（第2版），科学出版社，2013。吴祖建等，生物信息学分析实践，科学出版社，2010。注意事项和要求•应用型课程，自学占很大比重，请课后自觉多练习•建议注册加入icourses（课件、习题仅注册登录后能查看）•按时上课，位置固定，课间不休（连续3个小时），如已掌握内容，经考察通过后可以早退•建议课前打印讲义，以便于上课时在讲义上做笔记•每2-3人为一组，上机练习时可以相互交流讨论，但请控制音量•请注意保持机房卫生，下机时清理自己机位，带走垃圾•共10次课，每次一列课后留下做清洁，不得早退成绩及考试•课程总成绩=课堂练习*28%+课后作业*12%+开卷考试*60%•课堂练习：至少完成7次，完成后命名为“学号_第N章.doc”提交到教师机（快捷键ctrl+T）•课后作业：数据库介绍（详见第一章）•考试方式：开卷（但单号做A卷，双号做B卷，记得带笔），凡修课者必需参加考试，否则0分•考试时间：一般于课程结束后2周内分组情况讲台A006A005A004A003A002A00119B001B002B003B004B005B006A012A011A010A009A008A007210B007B008B009B010B011B012A018A017A016A015A014A013311B013B014B015B016B017B018A024A023A022A021A020A019412B019B020B021B022B023B024A029A028A027A026A025513B025B026B027B028B029A035A034A033A032A031A030614B030B031B032B033B034B035A041A040A039A038A037A036715B036B037B038B039B040B041A047A046A045A044A043A042816B042B043B044B045B046B04717B048B049B050B051B052B053本课程有部分作业需要协作完成，建议大家自由组合。每2-3人为一组，相邻就座，上机练习时可以相互交流讨论。尽量靠前坐。