研磨珠的选择

研磨珠的选择当提到从各种样品中提取DNA或RNA，最快速彻底的样品处理办法就要数研磨珠高速击打破碎。无论研磨均质微生物、老鼠组织、植物种子或叶子，还是各种土壤，使用研磨珠都能有效打破细胞壁和细胞膜，释放出DNA、RNA，供下游提取纯化。目前市场上有大量各种类型研磨珠供选择，使用者往往无从下手。本文总结归纳了在MoBio实验室使用的各种研磨珠的特性，以及适合处理的样品类型，供参考。在之前的文章，根据RNA提取的特点详细地讨论了该使用的研磨均质条件。今天将全面讨论DNA、RNA提取过程中研磨珠的选择。涡旋仪：通常在涡旋仪上使用研磨珠套管的情况最多。涡旋仪非常适合用于样品DNA提取的研磨均质。因为它动作相对缓和，能最大程度上保持DNA的完整性。0.15mm石榴石（Garnet）：用于提取微生物纯培养的DNA，也适合于菌液的离心沉淀、水过滤物、尿沉淀，或败血症血培养。沙粒样的石榴石颗粒表面粗糙不平，非常有利于细胞壁的破解。但其硬度相对比较低，在涡旋仪研磨击打条件下，对DNA损伤较小。使用石榴石的试剂盒：我们在UltraClean®MicrobialDNAKit、PowerFoodDNAKit(0.5mltube)和BacteremiaDNAKit(2.0mltube)上使用此类型研磨珠0.7mmGarnet石榴石（Garnet）：此种研磨珠由各种大小不一、表面粗糙不平、外形各异的锋利小石块组成。锋利而坚硬，能有效破碎半固体状及坚硬样品。使用0.7mm石榴石的试剂盒：使用涡旋仪破碎2ml管动物组织样品：UltraCleanTissueandCellsDNAIsolationKit；2ml管土样样品：UltraCleanSoil、PowerSoilDNAIsolationKits及PowerFecalDNAIsolationKit,15ml管：RNAPowerSoilIsolationKit、UltraCleanWaterDNAIsolationKit50ml管：PowerMaxSoilDNAIsolationKit.0.15mm/0.7mm石榴石：PowerwaterDNAIsolationKits及RapidWaterDNAIsolationKits的5ml研磨珠套管就使用了这两款研磨珠混搭。更换成5ml厚壁管意味着不用折叠47mm水样滤膜就能轻松塞进研磨管中。这里提供了更多水样滤膜的选择技巧。研磨珠的混搭可以最大程度地释放滤膜表面及内陷的微生物到研磨管。0.25mm碳化硅：此款研磨珠均为锋利的小薄片。薄片碳化硅能高效破坏微生物细胞，并剪切基因组DNA。通常用来制备RNA。使用0.25碳化硅研磨珠的试剂盒：我们使用此研磨珠在UltraCleanMicrobialRNAIsolationKit0.5ml管中提取微生物RNA；还在BiosticStabilizedBloodRNAIsolationKit上用于过柱吸附RNA前对基因组DNA进行破碎。此举大大减轻了RNA制备的后期处理工作。涡旋仪或高速研磨机：玻璃研磨珠都能用在涡旋仪和高速研磨机上。而相对来说，其跟适合于后者。因为玻璃珠在高速研磨过程中不会发生崩解。0.1mm玻璃珠：细小的玻璃珠直径只有0.1mm。圆球外形非常坚硬，在强大外力作用下依然保持完整。是处理某些类型土壤（如：粘土、沉淀物和沙土）最理想的选择。提取真菌、孢子DNA也能得心应手。适合涡旋仪和PowerLyzer使用。使用0.1mm玻璃珠的试剂盒：我们在PowerLyzerUltraCleanMicrobialDNAIsolationKit0.5ml管和PowerLyzerPowerSoilDNAIsolationKit2ml管中使用此研磨珠。更多关于有效提取粘土DNA的数据。0.5mm玻璃珠：下一个要介绍的是0.5mm玻璃研磨珠。其球状外形及高硬度同样适合用于高速研磨机。不过我们尚未应用到试剂盒上。在提取菌类DNA及需要轻质大个研磨珠场合上比较适用。我们提供了2ml装的研磨珠套管。高速研磨机上使用的研磨珠套管：下面的击中研磨珠直径较大，适合用于破碎坚硬样品或者RNA的提取。因此，一般的涡旋仪不能满足所需作用力。2.38mm金属研磨珠套管:我们实验室通常用来提取植物DNA。金属研磨珠质地非常坚硬，在一般涡旋仪上可以用来提取柔软的植物组织。而对于大部分植物样品，在高速研磨机上使用能释放出更多DNA。金属研磨珠很好地应用于植物DNA提取的另一个原因是，植物DNA提取的裂解缓冲液中不含有腐蚀金属球的离液盐，不会导致其锈色。此研磨珠在我们的厚壁管中高外力情况下使用不会发生破裂。使用2.38mm金属研磨珠套管的试剂盒：PowerPlantDNAIsolationKit。1.4mm陶瓷研磨珠套管：细小的陶瓷研磨珠提取幼小样品RNA，有时比2.8mm研磨珠来得更有效率。经过试验证明，对于所有类型植物和动物组织，2.8mm陶瓷研磨珠是最好用的。所以我们没有把1.4mm陶瓷研磨珠应用在试剂盒上。但也不排除客户有特殊应用。市场上商品化名称有时会把陶瓷研磨珠称为锆石。而锆石就是一种陶瓷材料。2.8mm陶瓷研磨珠套管：我们把此研磨珠应用于几乎所有PowerLyzer系列的试剂盒上。2.8mm陶瓷研磨珠非常适合于提取各种动植物组织RNA。而且在提取RNA必须使用的高离盐裂解液中不会生锈或变色。研磨珠已经预装在厚壁管中。使用2.8mm陶瓷研磨珠的试剂盒：PowerLyzerUltraCleanTissue&CellsRNAKit和PowerLyzerUltraCleanPlantRNAKit。所有的研磨珠套管都可以单独购买，以便于开发你自己的操作流程和尝试新的混搭。为了节省你的经费，大部分研磨珠都有散装销售。厚壁管也可以单独购买。