uniprot实际应用

UNIPROT数据库应用实例医学生物化学与分子生物学2014602619郭振昌实例：提取HELA细胞全细胞裂解液中的蛋白，通过质谱分析得到相应肽段，再利用PROTEOMEDISCOVERER软件搜索HELA细胞中蛋白的种类意义：通过比较HELA细胞与正常细胞的蛋白种类，进一步确定细胞癌变后蛋白种类的变化，为研究治疗药物奠定基础进入UNIPROT页面，搜索所需要的数据库下载数据库选取对应的格式进行下载此为下载完成后的UNIPROT-MOUSE数据库PD软件界面添加数据库到软件点击add进行添加选择UNIPROT-HUMAN数据库新建一个搜索添加要搜索的数据在设置参数中选择数据库打开搜索完成后的文件得到蛋白得分，双击可查看蛋白序列稍后对P10809在数据库网页中进行搜索蛋白序列蛋白在数据库中对应的序列对P10809进行数据库中搜索，得到其具体信息并且我们可以得到其数据库中的序列，可与前面分析得到的数据比较进行评价从软件分析中我们还可以得知在该数据库中符合该蛋白的肽段将所得数据导入EXCEL表，方便数据的查询与筛选谢谢大家！