abca1基因全编码区snp筛选及外显子7、16snp意义的研究

第一军医大学硕士学位论文ABCA1基因全编码区SNP筛选及外显子7、16SNP意义的研究姓名：查政申请学位级别：硕士专业：心血管内科指导教师：郭志刚20060520ABCA1基因全编码区SNP筛选及外显子7、16SNP意义的研究作者：查政学位授予单位：第一军医大学相似文献(10条)1.学位论文刘亚洋ABCA1基因全编码区SNP筛选及R1587K与血脂及冠心病的关系2006背景、目的ATP结合盒转运子A1(ATPbindingcassettetransporterA1，ABCA1)为ATP结合盒转运子家族中的一员，它表达的细胞膜蛋白促进细胞内游离胆固醇和磷脂的流出，参与胆固醇逆转运(RCT)，即将外周组织细胞内过剩的胆固醇转移外运并形成高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)至肝脏代谢。而细胞内的胆固醇与磷脂转运至HDL前体apoA-1是RCT的第一个限速环节。因此，它在胆固醇逆转运过程中起着关键性作用。其功能障碍将导致细胞内胆固醇流出受阻而大量沉积，巨噬细胞可形成为泡沫细胞。ABCA1的基因突变可导致Tangier病和家族性低α脂蛋白血症(FHA)，表现为低高密度脂蛋白胆固醇血症和早发冠心病。ABCA1基因不仅在Tangier病中起重要作用，而且与动脉粥样硬化(AS)和冠心病(CAD)的发生密切相关。过去的流行病学也证实，HDL-C具有抗动脉粥样硬化作用，抑制动脉粥样硬化的发生发展，血清HDL-C水平与冠心病显著负相关，这主要归因于HDL在胆固醇代谢尤其是胆固醇逆转运中所发挥的重要作用。ABCA1基因变异的最常见方式是单核苷酸多态性(SNP)，ABCA1基因的SNP广泛存在，多项研究表明：在普通人群及冠心病人群中，部分单核苷酸多态性(SNP)与血脂水平及冠脉狭窄程度有相关性；在不同种族中，同一SNP分布频率不同，同一SNP对血脂水平和冠状动脉狭窄程度的影响也不尽相同。研究显示ABCA1基因非编码区(如在启动子区、内含子1区和5'不翻译区)的一些SNP对控制ABCA1的表达起着重要作用，并与血脂水平及冠心病的发生有密切关系。本课题组以前已对启动子区感兴趣的SNP位点-477C/T和-191G/C进行了研究。研究显示中国汉族人群的ABCA1基因启动子区-477C/TSNP的T基因可能是冠心病的易患基因，C基因则可能是冠心病的保护基因。-477C/TSNP与冠心病严重程度及冠脉病变严重程度也相关。CAD组中，TT基因型表现为显著减低的HDL-C水平。-191G/CSNP的C等位基因可能是冠心病的易患基因，G等位基因则可能是冠心病的保护基因。-191G/CSNP不仅与冠心病的发生相关，而且对冠心病严重程度亦有影响，与冠脉病变的稳定性相关。-477C/T对冠心病的影响主要通过对HDL-C水平的影响发挥作用，而-191G/C可能通过影响炎症因子对冠心病的发生发展产生影响。编码区国外多项研究显示ABCA1的外显子基因多态性与血浆脂质水平及冠心病易感性有着不同的关联性，已经研究较多的有外显子区的R219K和M883I等。在这些研究中，已报道R219K型ABCA1与上升的HDL-C或下降的动脉粥样硬化呈正相关。也有一些研究表明，此SNP的抗动脉粥样硬化效应只在某种特定的环境下观察到：如女性，具有较高LP(a)的个体或吸烟者。这些发现说明，R219K的功能效应只在特定的遗传和环境背景下才具有显著意义。除R219K外，V771M、I883M型的ABCA1可能也与抗动脉粥样硬化有关。I883M型ABCA1主要提高HDL-C，降低甘油三酯水平，V771M型ABCA1主要提高HDL-C和apoAI。E1172D、R1587K型ABCA1主要降低HDL-C，可能易感动脉硬化。我们利用PCR-SSCP-测序法对冠心病组ABCA1基因全部编码区50个外显子进行检测，发现冠心病组和正常人组的ABCA1第35外显子存在R1587K多态性。我们对ABCA1基因35外显子R1587KSNP在中国汉族人群中的发生情况进行研究，并阐明该多态性与脂代谢及冠心病易感性的关系。该多态性为35外显子第1587密码子G→A，使ABCA1蛋白质第1587位精氨酸(R)变为赖氨酸(K)。材料和方法均为汉族人，分为冠心病组及正常人组。冠心病组112例，男性79例，女性33例，年龄60.76±11.27岁，其中行冠脉造影确诊55例，临床症状结合心电图、超声心动图、平板运动实验及心肌灌注ECT显像表现证实57例。均排除严重肝、肾、肿瘤等疾病。正常人组108例，男性74例，女性34例，年龄59.89±7.92岁。经询问病史、体检、实验室检查(血、尿、便常规，血脂，血糖，肝、肾功能)、心电图、胸片等检查排除冠心病、高血压病、糖尿病、肿瘤和严重的肝、肾疾病。两组间性别、年龄无显著性差异。用试剂盒提取静脉血白细胞基因组DNA。引物引入限制性内切酶分析聚合酶链反应(Primer-introducedrestrictionanalysisPIRA-PCR)方法对ABCA1的R1587K多态性进行检测。我们比较了两组、三种基因型间相关临床指标包括总胆固醇(TC)、总甘油三脂(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、极低密度脂蛋白胆固醇(VLDL-C)、体重指数(BMI)。结果1.ABCA1基因编码区R1587KSNP存在于中国汉族人群中，其分布为：全部检测人群中RR型占49.1％(108例)，RK型占44.1％(97例)，KK型占6.8％(15例)。冠心组和正常对照群体等位基因频率符合Hardy-Weinberg平衡(x2=0.0206，2.1965，df=1，P=0.886，0.138)，可以认为具有人群代表性。2.ABCA1基因R1587KSNP在中青年组(＜60岁)和老年组(≥60岁)两个年龄组的分布差异无统计学意义(x2=1.018，3.264，df=2，P=0.601，0.196)。3.ABCA1基因R1587KSNP在男女性别组的分布差异无统计学意义(x2=0.877，0.405，df=2，P=0.645，0.817)。4.冠心病组与正常人组等位基因的频率(x2=0.496，df=1，P=0.481)、三种基因型频率分布无显著差异(x2=1.605，df=2，P=0.448)。5.K基因型携带者与非携带者罹患冠心病的风险无显著差异(OR=0.862；95％CI=0.57～1.30；P=0.481)。6.冠心病组及正常人组中R携带者组HDL-C水平均高于非携带者组(P=0.003，0.003)，冠心病组和正常人组的RR、RK、KK基因型亚组间HDL-C差异有统计学意义(F=14.97，14.52，P＜0.001，0.001)。冠心病组KK组与RR、KK组两两比较HDL-C水平差异有统计学意义(P＜0.001，P＜0.001)。正常人组KK组与RR、KK组两两比较HDL-C水平差异有统计学意义(P=0.009，P=0.020)。多重回归分析提示R1587K基因型对HDL-C水平的影响有统计学意义(P＜0.001)。三种基因型的TC、TG、LDL-C、VLDL-C、BMI差异无显著性意义。结论1.ABCA1基因编码区R1587KSNP存在于中国汉族人群中。2.冠心病组及正常人组的ABCA1基因R1587KSNP在中青年和老年两个年龄组的分布差异无统计学意义。3.冠心病组及正常人组的ABCA1基因R1587KSNP在男女性别组的分布差异无统计学意义。4.冠心病组与正常人组等位基因的频率、三种基因型频率分布无显著差异。ABCA1基因编码区R1587K携带情况与人群血浆HDL-C水平密切关联，K携带者血浆HDL-C水平下降。三种基因型的TC、TG、LDL-C、VLDL-C、BMI差异无统计学意义。总之，ABCA1基因R1587K多态性可显著影响冠心病患者和正常人的血浆HDL-C水平，K等位基因是导致HDL-C降低的重要原因，但R1587K与冠心病的发生无明显相关性。2.学位论文刘胜林ABCA1基因启动子区-477C/T单核苷酸多态性与血浆高密度脂蛋白水平及冠脉病变的关系20041999年,人们首次明确ATP结合盒转运子1(ABCA1)基因突变是Tangier病的病因.Tangier病主要表现为血浆HDL-C、载脂蛋白AI(Apo-A1)严重减低和早期冠心病.而在普通人群中(包括正常人及冠心病人),ABCA1基因变异的最常见方式是单核苷酸多态性(SNPs).ABCA1基因是控制胆固醇外流的限速基因,在胆固醇逆转运和HDL-C形成中发挥着重要作用.多项研究表明:在普通人群中,部分ABCA1基因SNPs与血脂水平及冠脉狭窄程度有相关性;在不同种族中,同一SNPs分布频率不同,而且同一SNPs对血脂水平和冠状动脉狭窄程度的影响也不尽相同.该实验的目的在于对中国汉族人群中冠心病人、正常人ABCA1基因启动子区-477C/TSNPs进行分析,以阐明汉族正常人群中ABCA1基因SNPs分布频率及其对血脂的影响;并进一步研究其与冠心病人血脂和冠状动脉病变的关系.结论:1.ABCA1基因-477C/TSNPs存在于中国正常人群中,其分布为CC基因型37.2％(42例),CT基因型46.9%(53例),TT基因型15.9%(18例).在正常组中,TT基因型血浆HDL-C明显减低.2.在冠心病组中,TT基因型表现为血浆HDL-C水平下降,ABCA1基因启动子区-477C/TSNPs不仅与冠心病的发生相关,而且对冠脉病变严重程度亦有影响,与冠脉病变的稳定性也存在相关性.3.ABCA1基因启动子区-477C/TSNPs对正常人、冠心病人群TC、TG、LDL-C、VLDL-C和BMI无明显影响.3.期刊论文刘胜林.郭志刚.刘凌.李欣ABCA1基因转录调节与胆固醇代谢及动脉粥样硬化的关系-中国分子心脏病学杂志2004,4(5)ABCA1(ATP-bindingcassettetransporterA1)可利用ATP参与胆固醇和磷脂从细胞内转运至贫脂或无脂的apoA1,促进高密度脂蛋白(HDL)生成,并在胆固醇逆转运(RCT)中起重要作用.ABCA1受多种因素调节,其中以核受体超家族的转录调节最为重要.上调ABCA1表达增加RCT、提高HDL血浆浓度是防治动脉粥样硬化(AS)的一个新方向,特异性肝X受体(LXR)激动剂可能是抗AS新药的希望所在.4.学位论文陈良川CRP及ABCA1基因第7外显子区R219K位点单核苷酸多态性在心房颤动中的意义2009一、研究背景心房颤动（房颤）是临床上最常见心律失常，常伴有脑卒中、心力衰竭等并发症发生，增加心血管疾病发病率和死亡率。因此在早期阶段诊断和治疗房颤，对预防顽固性房颤和心血管事件的发生有着重要意义。目前，我们对心房的早期病理生理变化不完全清楚，主要是由于对房颤分子生物学机制了解甚少，对房颤基因学的研究为房颤发病病因的了解提供了新的视野。少见家族性房颤主要由遗传性分子缺陷引起电生理异常所致，然而临床大部分房颤属非家族性房颤，与心房结构重构有关。队列比较研究显示肾素-血管紧张素-醛固酮系统及炎症相关基因基因单核苷酸多态性（SNP）房颤的发生有关，表明房颤形成复杂性。ABCA1基因是心血管疾病研究最常见的候选基因，它以ATP为能源，在胆固醇逆转运（reversecholesteroltransport，RCT）和高密度脂蛋白（highdensitylipoprotein，HDL）生成起始步骤中起重要的作用。现有研究表明ABCA1基因可能通过减少HDL-C水平来增加氧化低密度脂蛋白（oxidizedlow-densitylipoprotein，OX-LDL）和炎症因子对血管壁的损伤，增加心血管疾病发生率，但是R219K位点SNP突变，可增加ABCA1基因的活性降低低密度脂蛋白胆固醇（lowdensitylipoproteincholesterol，LDL-C）水平、增加HDL-C水平的趋势减少心血管疾病发生。越来越多的证据表明ABCA1基因SNP与冠心病、