非洲猪瘟ASF的分子病毒学

非洲猪瘟的分子病毒学非洲猪瘟病总列数确诊时间发生省份发生地点发病头数死亡头数扑杀数18月3日辽宁省沈阳市沈北811628月16日河南省郑州3030136238月19日江苏省连云港海川881457748月23日浙江省温州市乐青340133258月30日安徽省芜湖市南陵县18580126469月2日安徽省宣城市宣州五星乡9472579月2日安徽省宣城市宣州古泉镇4089月3日安徽省宣城市金坝152899月3日江苏省无锡市宜兴12997109月5日黑龙江省佳木斯长青乡3912119月6日安徽省滁州市凤阳县6222129月6日黑龙江省佳木斯向阳区2610139月6日安徽省芜湖市南陵县许镇134149月6日安徽省宣城市宣州区天湖1515159月10日安徽省铜陵市义安区6323169月14日内蒙古阿巴嘎旗179月14日河南省获嘉县科技日报2018年8月22日报道•我国发生非洲猪瘟的病毒基因测序初步结果显示，引起我国本次非洲猪瘟疫情的毒株为基因Ⅱ型，部分基因序列与格鲁吉亚2007株和俄罗斯伊尔库茨克2017株的相应序列完全一致。提要ABSTRACT01/病毒的简述02/分类学地位03/形态学特征04/病毒稳定性05/基因组特征06/主要的蛋白非洲猪瘟•非洲猪瘟（AfricanSwinefever，ASF）是一种急性，发热传染性很高的滤过性病毒所引起的猪病，其特征是发病过程短，但死亡率高，临床表现为发热（达40~42℃），心跳加快，呼吸困难，部分咳嗽，眼、鼻有浆液性或粘液性脓性分泌物，皮肤发绀，淋巴结、肾、胃肠粘膜明显出血；•非洲猪瘟在临床症状上与典型猪瘟极为相似，以高热、高死亡率、全身广泛性出血、呼吸障碍以及神经功能紊乱为主要特征。联系区别病毒分类CSF是黄病毒科瘟病毒属，单链RNA病毒，可分为3种基因型，11个亚型，1个血清型ASF是非洲猪瘟病毒科非洲猪瘟病毒属，双链DNA病毒，根据编码p72蛋白的B646L核酸序列，非洲猪瘟可分为23个基因型，1个血清型毒株特点不同毒株毒力差异大CSF在中国流行主要是基因2.1b亚型的中等毒力毒株ASF强毒株感染4-10天后100%死亡，中等毒株死亡率30%-50%，低毒株仅少量死亡传播特点CSF与ASF都可通过接触传播或由于接触污染的媒介物传播，发病无季节性欧洲野猪与家猪比较容易被ASFV感染，有三种非洲野猪（疣猪、巨林猪、丛林猪）不表现出症状，隐性带毒，成为病毒的贮存器。ASFV是唯一的虫媒DNA病毒，可通过软蜱传播，病毒在其体内保持感染性造成持续传播，ASFV在蜱和野猪感染圈中长期存在，难以根除，并在一定条件下感染家猪，引起暴发联系区别临床症状+剖检病变临床症状和剖检病变整体相似性很高，肉眼无法鉴别，实验室检测是诊断最可靠、最准确的方法CSF剖检病变脾脏肿大不明显，边缘梗死灶明显，肺脏病变主要以出血性病变为主ASF剖检病变脾脏肿大，梗死灶不多见，肺脏表现水肿ASF死亡前48h体温下降为其特征同时临床症状直到体温下降才显示出来，与CSF体温升高时症状就出现不同宿主免疫不感染人，不是人兽共患病预防CSF最有效的方法就是接种猪瘟疫苗ASFV强毒株基因组可编码多种蛋白质，用以干扰宿主的天然免疫系统，从而抑制和逃避宿主的免疫应答反应，为自身的增殖、扩散创造有利条件，ASFV拥有庞大的基因组结构和复杂的免疫逃逸机制，为疫苗研发工作带来诸多困难防控手段具有高度的传染性与致死性，易大面积发病感染CSF：接种猪瘟疫苗，免疫后可完全保护，不会再出现大面积发病，疫情较容易控制ASF：无有效疫苗，以扑杀为主并进行无害化处理分类学地位•国际病毒分类委员会第四次报告将其归类于虹彩病毒科（粒子结构）•国际病毒分类委员会第五次报告将其归类于痘病毒科（基因结构、复制方式）•国际病毒分类委员会第六次报告增加了非洲猪瘟科，将其列入非洲猪瘟属，是其中的唯一成员（分子生物学发展）形态学特征•ASFV是有囊膜包裹的的正二十面体病毒。毒粒外周包裹有六角形的囊膜，外部是直径为170-200nm的二十面体衣壳，对应2000个左右衣壳粒，衣壳粒长约13nm，宽约5-6nm，衣壳粒间距离为7.4-8.1nm，呈中间有孔的六边形棱柱体。粒子的内部是直径为70-100nm的病毒核心，由包含基因组核酸的核蛋白以及类核结构组成。•病毒从外至内由5个部分组成：外囊膜、病毒衣壳、内囊膜、核壳、类核DNA外囊膜病毒衣壳内囊膜核壳类核形态学特征病毒稳定性•ASFV具有很强的致病性，对外界不同的极端环境有很好的抗性。56℃下加热70min或60℃下加热20min可使病毒失活。在pH4-10的条件下，病毒仍可保持活性。将猪肉自然风干制成的腊肠，或者32-49℃下烟熏12h，然后自然风干25-30天制成火腿，猪肉中携带的非洲猪瘟病毒也无法被全部杀死，仍然具有感染活性。基因组特征•ASFV的基因组为具有末端共价闭合特点的单分子线状双链DNA，大小为170-190Kb，两末端部分碱基配对形成发夹环，中间区域较为保守，长度约125Kb，是一段高度保守的基因序列。两端靠近发夹环部位有末端重复序列和可变区，可变区分别命名为VL（38-47Kb）与VR（13-16Kb），是不同病毒毒株之间基因组差异主要的部分，与病毒的变异、逃避宿主防御系统等机制密切相关，ASFV基因组大小变化由可变区决定。整个基因组含有约150个开放阅读框（ORFs），可编码150-200种蛋白质。基因组特征•截止目前，完成全基因组测序的毒株共有20株，其中，适应Vero细胞培养的无毒力BA71V毒株，是广泛应用于实验室研究的毒株。毒株名称基因组大小（kb）毒株名称基因组大小（kb）BA71V170Warmaths191L60182Tengani62186BA71180Pretorisukop_96-4190NHV172Mkuzi1979193Kenya1950194MalawiLil-20-11983188Kenya05/TK119147/Ss/2008185Ken06.Bus184Benin97/118226544/OG1OItaly183OURT88/3172Odintsovo_02/14189E75181Warthog187Georgia2007/1189病毒蛋白质非结构蛋白结构蛋白病毒基因组编码的，在病毒复制过程中产生并具有一定功能，但并不结合于毒粒中的蛋白质构成一个形态成熟的具有感染性的病毒颗粒所必需的蛋白质（衣壳蛋白，囊膜蛋白，存在于毒粒中的酶）主要的蛋白DNA外囊膜病毒衣壳内囊膜核壳类核p12（O61R）p24CD2v（EP402R）p14（E120R）p49（B438L）p72（B646L）p150p37p34p14p5p35p15p8pp220pp62Proteasep12（O61R）p17（D117L）p22p54（E183L）pE248RpH108RpE199LRP1RP5RP2RP6RP3RP7pD1133LpQ706LpG1340LpB962LPoly(A)polCappingenzymeMethyltransferasep10pA104RRNA聚合酶亚基转录因子RNA修饰酶与DNA结合的主要结构蛋白DNApolXDNAligaseAPendonuclease碱基切除修复