PubMed使用攻略--医学生必备

数据库张士靖医药卫生管理学院[e-mail]华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介1.PubMed基本情况2.PubMed的由来3.PubMed的数据范围4.PubMed的特点5.PubMed主页华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介1.PubMed基本情况PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统，是继MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之后推出的一种网络免费检索方式。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院包括2,100多万篇来自MEDLINE和其他生命科学期刊的生物医学文献最早可回溯到1948年提供部分全文和其他相关资源的链接一、PubMed简介华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介2.PubMed的由来创刊:最早可以追溯到1879年美国NLM编译出版的医学文献检索刊物《医学索引》（IndexMedicus,IM）。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1964年:为了实现IM的自动化编辑出版，NLM开发了“医学文献分析与检索系统”（MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem,简称MEDLARS）.目前MEDLARS已拥有40多个数据库，其中最重要、最大、且发展最早的为MEDLINE(MEDLARSONLINE)生物医学数据库华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1971年:MEDLINE正式建成联机数据库，并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。自MEDLINE投入联机检索服务以来，一直成为MEDLARS最大的使用频率最高的数据库。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1983年：随着光盘技术的发展，MEDLINE光盘数据库建成，并得到了广泛的应用。1997年9月26日，MEDLINE网络版开通，取名PubMed，并向全球免费开放。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间，却不愿花上几个小时去认真研究一下PubMed。君欲善其事，必先利其器，PubMed就好像一把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。一、PubMed简介华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介出版商提供的书目信息PreMedlineMEDLINE与NCBI其它数据库的链接3.PubMed的数据范围华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3.1MEDLINE基本情况出版：美国国家医学图书馆（NationalLibraryofMedicine,NLM）。印刷版1879联机版1971光盘版1983网络版1997MEDLINE数据库简介华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院MEDLINE数据库简介收录范围：收录7538种（2009.10.11）权威期刊，包含50种语言，涉及70多个国家（其中中国48种），约40万篇/年，已经累计2100余万篇。内容涉及生物医学各个领域；85%原文为英语。回溯年代：1948年至今每条记录标有[indexedforMEDLIEN]标记华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院内容涵盖三种重要的纸本医学文献检索工具：IndexMedicusIndextodentalLiteratureInternationalNursingIndex华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院学科范围：基础生命科学临床生命科学生物科学解剖学组织学化学与药物心理学社会医学农业医技设备学医技工业学医学信息学使用词表：MeSH（医学主题词表）华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3.2PreMEDLINE是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库，这些新记录还未被标引，暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新，经过标引（增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段）以后转入Medline，一旦记录被转入到Medline数据库，就被从PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标有[inProcess]标记。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院Pre-Medline最新信息MedlineNewDataCollectPubMedProcessPubMed一周以后华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院（Publisher-SuppliedCitation）出版商直接向PubMed提供的非Medline收录的电子刊物，每条记录标有[assuppliedbypublishers]标记。（如：Science或Nature中的地质学文献等）。3.3出版商提供的书目信息华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院标记不同，其数据来源亦不同华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3.4与NCBI其它数据库的链接Nucleotide：DNA序列数据库Protein：蛋白质序列数据库Genome：基因组序列数据库Structure：分子结构模型数据库OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库PMC:PubMed中心，免费全文期刊检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院与NCBI其它数据库的链接华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3.特点收录生物医学权威期刊最多世界上70多个国家的7000多种权威期刊多种检索方法，多条检索途径时效性极强(每周更新)回溯年代久远（1948年至今）利用MeSH作为转换词表，标引质量高部分文献可以免费获取全文检全率、检准率高BACKPubMed简介华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院4、PubMed主页网址：简介PubMedcomprisesmorethan21millioncitationsforbiomedicalliteraturefromMEDLINE,lifesciencejournals,andonlinebooks.Citationsmayincludelinkstofull-textcontentfromPubMedCentralandpublisherwebsites.华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院一、PubMed简介二、检索途径和方法三、检索结果处理四、其他辅助检索主要内容五、免费获取全文华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1、基本检索2、高级检索3、主题词检索二、检索途径和方法华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1.基本检索MeSH转换表（词语检索及自动词语匹配）期刊转换表短语表作者姓名索引逻辑运算符检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院Pubmed基本检索实例例一“肝癌和肝炎的关系”“livercancer”和“hepatitis”第一步选择关键词输入检索框livercancerhepatitis华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1.基本检索检索前，选择需查询数据库。下拉菜单中显示Entrez系统提供的所有数据库，可任意选择进行检索。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院可看到该检索词下命中的所有文章、综述及免费全文华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院CombinedFunctionalGenomeSurveyofTherapeuticTargetsforHepatocellularCarcinoma.SatowR,ShitashigeM,KanaiY,TakeshitaF,OjimaH,JigamiT,HondaK,KosugeT,OchiyaT,HirohashiS,YamadaT.ClinCancerRes.2010Apr13.[Epubaheadofprint]PMID:20388846[PubMed-assuppliedbypublisher]Relatedcitations这条记录包含几个字段?华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院文摘格式华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院注意检索词的使用截词检索当检索词结尾不确定时,可用*替代精确检索用双引号“”将要检索的多个词限定为一个词进行检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院截词检索和字段限定检索例如：输入cell*[ti]可以查出标题中含cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院“”将短语做为不可分割的整体进行检索。如：“oxygenfreeradicals”注意：“”必须为英文半角状态下输入华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1、基本检索2、高级检索3、主题词检索二、检索途径和方法华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院2.高级检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院高级检索界面下可进行多种检索条件的限定。同时可显示检索历史，允许使用检索史序号进行组配检索。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院检索框预览检索史限定检索30个字段可选择作者、刊名、出版日期等多个项目进行任意组合检索。如果输入框不够，可点击“AddMoreFields”添加华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院限定检索字段限定检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院高级检索—限定检索设定只搜索包含摘要、全文或免费全文的文献在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围内搜索只搜索某语种出版的文献或特定的文章类型只搜索PubMed数据库的某一子数据库只在某一特定的字段中搜索，缺省是所有字段华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院Eg.检索2002年以来发表在Nature杂志上关于糖尿病（diabetes）的英文文献，要求能获得免费全文限制检索案例华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院检索框输入检索词对应字段名称填写期刊名称和时间范围限定只链接到可免费获取的全文华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院限定语种为英文最后点击检索输入框后的Search华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院13篇。大大减少了文献数量华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院高级检索——检索史（SearchHistory）当至少运行一次检索后，即可使用History检索史中显示的是你前面所做的查询方案和查询结果（检索序号、检索式、检索时间和检索结果数量）注:1、检索史中最多可保留100个检索式，超过100个时将自动删除最早的检索式。2、系统在休止状态对检索式的保留时间为8小时，8小时后检索式自动消失。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院详细检索策略（Details）主要用于描述所输入检索式的详细检索过程，即系统将用户所输入的检索词自动转换为哪些词（如MeSH词等），并使用什么样的句法（检索规则）来进行检索。同时也包含了任何的错误信息。华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院系统将输入的检索词与MeSH转换表进行对照,自动按照转换后的检索式进行组配和检索.华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院1、基本检索2、高级检索3、主题词检索二、PubMed的检索途径和方法华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3、主题检索主题词检索华中科技大学同济医学院医药卫生管理学院3、主题检索单篇/多篇引文匹配临床咨询专题咨询主题词检索期刊检索临床实验外部链接华中科技大学同济医学院医药卫生