Pclamp10-软件的使用

Pclamp10软件的使用马普科学仪器有限公司pCLAMP10组成部分pCLAMP10组成部分：Clampex10，用于数据采集与刺激输出。Clampfit10，用于数据分析。AxoScope10，用于背景信号的记录。MiniDigi，双通道数字转换器。pCLAMP10的特点Clampex是一个强大的通用工具，她适可用于所有类型数字化数据的采集。除了其特别擅长的膜片钳记录之外，她的功能也并不限于电压与电流钳制反应的记录。所有可以转换为电压变化的物理参数都可以用Clampex进行记录。例如，你可以检测与记录终板电流，测量光电倍增管输出的荧光信号，测量应变计量表的压力，或者是其他任意的模拟信号。Clampfit是一强大的数据分析程序，对电生理数据提供了多种类型的统计，分析，转换功能，才外还包含多种设计工具。AxoScope软件与MiniDigi数字转换器充当了传统的独立图表记录器的功能，并用于在实验的同时记录实验中的背景信号。AXOSCOPEAxoScope是Clampex的精简版。它提供了几种连续记录模式，但并不提供episodicstimulation模式，所以AxoScope是无法输出刺激的。同样，在AxoScope中也不包含MembraneTest和其他许多Clampex中的高级功能，例如LTPAssistant，JunctionPotentialCalculator和设备通讯的功能。使用MiniDigi数模转换器（其属于pCLAMP10系统的一部分）在Clampex记录数据的同时，可将AxoScope作为一个图表记录器用来记录试验中的背景信号。MINIDIGI1MiniDigi1数字转换器是一个低噪声，双通道的数字转换器，是设计用来与AxoScope共同作为一个数字图表记录器使用的。它包含两路相互独立的16-bit模拟输入通道，每一通道支持的最高采样率为1kHz。MiniDigi1数字转换器使用USB接口与电脑相连。MiniDigi数字转换器可与AxoScope一起使用，但不能在Clampex中使用电脑要求：最小系统需求推荐系统需求Windows兼容PC，配备1GHz奔腾系列CPUaWindows兼容PC配备2GHz（或更高）奔腾系列CPUaWindows2000操作系统WindowsXPProSP2操作系统128MB内存256MB内存或更高CD-ROM驱动器（用于软件安装）CD-ROM驱动器（用于软件安装）1024X768显示系统用于Clampfit800X600显示系统用于Clampex1024X768显示或更高USB1.0接口USB2.0接口用于Digidata1440数字转换器USB（1.0或2.0）接口用于安全密钥PCI插槽（全高）bPCI插槽（用于Digidata1320系列数字转换器）信号连接Clampex信号Digidata1440BNC面板接口Digidata1440BNC接口名称4路模拟输出通道ANALOGOUTPUTS（前面板）0-316路模拟输入通道ANALOGINPUTS（前面板）0-15Telegraphs(Gain,Frequency,CmCapacitance)TELEGRAPHINPUTS（后面板）0-38路数字输出DIGITALOUTPUTS（前面板）0-7单路数字转换器启动输入（前面板）START单路外部标签输入（前面板）TAG示波器触发输出（前面板）SCOPEClampex使用下列在Digidata1440系列数据采集系统上的BNC连接Clampex使用下列在Digidata1320系列数据采集系统上的BNC连接：Clampex信号Digidata132xBNC接口区域Digidata132xBNC接口名称2路模拟输出通道ANALOGOUT（前面板）0-116路模拟输入通道ANALOGIN（前面板）0-15Telegraphs(Gain,Frequency,CmCapacitance)TELEGRAPHINPUTS（后面板）0-48路数字输出DIGITALOUT（前面板）0-3DIGITALOUTPUTS（后面板）4-7单路数字转换器启动输入TRIGGERIN（前面板）START单路外部标签输入TRIGGERIN（前面板）TAGDigidata1322A示波器触发输出（后面板）TRIGGEROUTPUTDigidata1320A/1321A示波器触发输出（后面板）ADCCLOCKOUTPUT模拟输出信号Clampex通过数字转换器上面的一个模拟输出通道来控制在试验中的钳制电压或者命令波形。如，ANALOGOUT#0通道就应该通过一BNC接线与微电极电压/电流钳放大器的外部命令输入接口（ExternalCommandInput）相连。如果放大器自身包含内部命令发生器，这时就要确定放大器是设置在接受外部命令控制的状态。数字转换器上的其他模拟输出通道可以用来控制单独的钳制电位或者用来输出其他的命令波形。模拟输入信号放大器的输出信号与数字转换器上的模拟输入通道相连。在Clampex中，这些模拟信号被数字化后显示在相应软件窗口中，在此期间你可以将此数字信号以数据文件的形式保存在硬盘上。数字输出Clampex支持八路TTL相兼容的数字输出。这些输出都可以以数位模式与命令波形一起同时输出信号，这让你可以在实验的同时控制其他设备，例如溶液换样器或者微量注射仪。这八路都可以设置为恒定输出模式，或者用序列键来控制。Clampex也可以输出一个专有的示波器触发信号，这样就可以和示波器同步进行信号采集。数字输入Clampex的触发输入可允许其他设备的外部触发来开始数据采集，其也可以支持触发的同时将时间，注释或标签信息直接插入数据文件。这些需要TTL相兼容的数字输入。Telegraph（通讯）Clampex可以接收多数放大器的“telegraph”信号，这些信号可以报告不同的增益，低通滤波还有全细胞电容补偿等放大器的相应设置。老型号的放大器是依靠不同的BNC接口来传送不同的telegraph信号的。要传输这些信号就必须使用电缆将放大器与数字转换器连接在一起。Digidata1320与1440系列的数字转换器就具有专门的telegraphBNC接口。MultiClamp700与AxoClamp900A放大器是使用计算机来进行控制的，所以telegraph信号就直接以数字化的形式传送给了Clampex从而就不需要任何的物理连线了。在Clampex中设置Digidata1320或1440系列数字转换器将Digidata数字转换器链接到计算机。如果是Digidata1440A，那么电脑会显示发现新硬件向导。请根据提示完成数字转换器的安装。这里不需要额外的硬盘空间，所以推荐自动在硬盘中搜索驱动。点击开始所有程序AxonLaboratorypCLAMP10.0Clampex10.0以打开Clampex软件。打开ConfigureDigitizer对话框然后选择“Change”按钮。在“ChangeDigitizer”对话框的“DigitizerType”列表中选择“Digidata1440Series”。点击“Scan”按钮以侦测数字转换器。完成后会显示“Available”并且“OK”按钮会变为可用状态。点击“OK”按钮退出此对话框，再次点击“OK”按钮退出“Digitizer”对话框。如此Digidata数字转换器即处于可用状态。Clampex软件中的窗口工具栏RealTimeControl菜单栏状态栏在主窗口之外，Clampex还包括七种窗口类型AnalysisDataFileIndexLabBookMembraneTestResultsScopeStatisticsAnalysisWindow（分析窗口）分析窗口用于显示已经存盘的文件，可对数据进行回顾与测量。其中数据是以图形化的形式显示的，并且文件中所记录的来自不同信号的数据会显示在不同的子窗口中。你可使用菜单FileOpenData命令在分析窗口中打开数据文件。在ViewDataDisplay你可以选择以不同的方式显示数据，如以Sweeps，Continuous或Concatenated模式来显示。在sweep模式下你可以选择任何的sweep来查看（ViewSelectSweeps），可以使一条，一部分或查看所有的sweep（ViewToggleSweepList）。当有多条sweep可见时，可以使用“”和“”方向按键在sweep间切换。有多达六对的“cursors”（游标，可变动位置的垂直直线）可以用来对激活的sweep进行简单测量。Cursortextboxes（游标文本框）中可以显示时间，幅度，采样点编号，或者是相对于对应游标的差值。要想对这些或者其他的游标进行设置可双击游标以打开CursorProperties对话框。前两组游标所测量轨迹的许多数值，可以通过点击分析窗口左上部的与按钮快速的输入到结果窗口中去。LabBook文本编辑器，它用来记录Clampex运行时所发生的事件，如打开一个protocol或改变钳制水平等。事件会被自动的写入其中你也可以使用ToolsCommenttoLabBook命令在其中加入注释，此外你还可以直接在LabBook中键入文字。在Clampex中的多个工具都提供了在LabBook中写入信息的选项，如MembraneTest。LabBook窗口会一直处在开启状态，这时其被称作SystemLabBook。它的备份可以被保存在磁盘中的其它地方用以编辑。MembraneTest（膜检测MembraneTest是一个用来监测在膜片钳实验的三个状态中多种相关参数的高级应用程序。此三种状态为：Bath：检测封接前在浴液中的电极电阻（以前被称作“SealTest”）。Patch：检测封接电阻，以帮助你形成G欧封接。Cell：检测细胞电阻和膜电容。你可以使用对话框上部的Stage按钮在这三种状态间进行切换。当你从一种状态切换到另一种状态时，相应的参数值都会被记录在LabBook中。Electroderesistance(Re，电极电阻)也被称为pipetteresistance(Rp)，是电极狭窄的尖端所产生的电阻。这一电阻并不包括电极尖端周围其他阻碍电流流动的因素所产生的电阻，这些因素包括，细胞残片，气泡，低电导溶液等。Accessresistance(Ra，接入电阻)是电极尖端周围其他阻碍电流流动的因素所产生的电阻与电极电阻的总和。接入电阻有时被叫做seriesresistance(Rs，串联电阻)。这一称谓在Axon放大器中会用到。Membraneresistance(Rm，膜电阻)是跨越细胞膜的电阻。Totalresistance(Rt，总电阻)是膜电阻与接入电阻的总和。当使用一个电极去封接膜的时候，如果封接成功（形成G欧封接）那么总电阻中的接入电阻就可以忽略掉，此时总电阻就基本和封接电阻是一致的。Sealresistance（封接电阻）是电极尖端与细胞膜之间形成的封接所产生的电阻MembraneTest会显示下列电极与胞膜特性的部分参数，显示的参数取决于窗口所处的状态：Totalresistance（总电阻）,RtAccessresistance（输入电阻）,RaMembraneresistance（膜电阻）,RmMembranecapacitance（膜电容）,CmTimeconstant（时间常数）,TauHoldingcurrent（维持电流,可相当于漏电流）,HoldResultsWindow（结果窗口）结果窗口中包含一个电子表格，它用来显示分析窗口中游标1，2还有3，4所测量的值。这些测量值包括时间与幅度的最大值，最小值，差值，平均斜率，均值还有标准差。你可以只选择相邻的行与列以进行复制与粘贴等操作参数的设置Telegraphs（通讯）对于多数的放大器，其相关设置都可以通过telegraph而被Cla