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医学图像处理MedicalImageProcessing学习,学习,再学习,有事没事,去书店看看书,关于管理,金融,营销,人际交往,未来趋势等这些,你能获得很多。这个社会竞争太激烈了,你不学习,就会被淘汰。中国2008底,有一百多万大学生找不到工作。竞争这么激烈,所以,一定要认识一点,大学毕业了,不是学习结束了,而是学习刚刚开始。—《赢在中国》主要内容:1图像配准概述;2基于特征的图像配准方法;3基于模板的图像配准方法;4MATLAB图像配准;第九章图像配准*主要内容:1图像配准概述;2基于特征的图像配准方法;3基于模板的图像配准方法;4MATLAB图像配准;第九章图像配准*图像配准概述─图像配准的定义问题的提出:临床上需要对同一个病人进行多种模式(CT、MRI、PET)或者同一模式的多次成像,并同时从几幅图像获取信息,进行综合分析;前提条件:解决两幅或多幅图像对应成像空间位置的严格对齐问题,即确定同一对象在不同图像中的对应点:图像配准概述─图像配准的定义图像配准(ImageRegistration):对一幅图像寻求一种(或一系列)空间变换,使它与另一幅图像上的对应点达到空间上的一致。这种一致是指对象上所有点(或至少所有感兴趣点)在两张已配准图像上有着相同的空间位置。各种图像配准的文献都会出现“配准、匹配、几何校正”三个词,它们的含义比较相似。图像配准概述─图像配准的定义图像配准举例:对图B寻求一种空间变换,使它与图A上的对应点达到空间上的一致。图B经空间变换后得到图C,在图A和图C中相同对象有着相同的空间位置。称图A和图C为已配准的图像,可以进行进一步的综合分析。图A图B图C图像配准概述─医学图像配准的类型同一对象(患者)的图像配准:不同对象间的图像配准:将被试的图像与典型正常人相同部位的图像或标准图谱进行对比,以确定被试者是否正常。如有异常,还要与一些疾病的典型图像对比,确定患者是否属于同类。备像来源于不同的成像设多模:待配准的两幅图准;、胸腹腔脏器的图像配图像序列的配准;、;、电镜图像序列的配准加权图像间的配准;、不同单模4fMRI32MR1图像配准概述─图像配准的常用方法基于特征的图像配准方法:先提取图像显著特征,如灰度变化明显的点、线等特征,通过特征集的映射建立两幅图像之间的空间变换关系。原则上该方法可用于配准任何模式的图像;最常用的是特征点法;基于模板的图像配准方法:在一幅图像中选取一个子图像窗口作为模板,大小通常为5×5或7×7,然后让该模板在另一幅图像中移动,通过计算相关函数来找到模板在搜索图中的坐标位置。该方法主要用于单模图象配准,特别是用于对改变较小的图像序列进行配准;主要内容:1图像配准概述;2基于特征的图像配准方法;3基于模板的图像配准方法;4MATLAB图像配准;第九章图像配准*基于特征的图像配准方法─步骤一般来说特征匹配算法可分为四步:特征提取:从两幅图像中提取灰度变化明显的点、线等特征形成特征集;特征空间映射:建立两幅图像特征集之间的空间多项式变换关系;非特征像素之间的映射:利用上述多项式变换关系对于非特征像素点进行空间变换,从而实现两幅图像之间逐像素的空间映射;灰度插值:由于空间映射得到的坐标值不一定为整数,因此需要进行灰度插值来确定这些坐标上的灰度值;基于特征的图像配准方法─空间映射设f(x’,y’)是待与图像G(x,y)配准的图像;g(x,y)是根据G大小生成一幅和G的坐标一致的空白图像;设两幅图像相同点对应的坐标之间的变换关系用下式描述:则可以从一幅图像的像素坐标算出另一幅图像对应像素的坐标。因此存在两种空间映射方法:前向映射和后向映射;),(),(21yxhyyxhx基于特征的图像配准方法─空间映射前向映射:由推出,逐点计算出f中每个像素对应于g中的坐标,然后利用灰度插值方法将f中每个像素的灰度值分配到它的4个最邻近像素上;f(x’,y’)g(x,y)),(),(21yxhyyxhx),(),(2111yxhyyxhx基于特征的图像配准方法─空间映射前向映射的缺陷:f中的一些点可能落在g图像的坐标之外;f中的多个点映射到g中的坐标可能有同样的最邻近像素,导致g中一个像素的灰度值被计算多次;f(x’,y’)g(x,y)基于特征的图像配准方法─空间映射后向映射:由,逐点计算出g中每个像素对应于f中的坐标,然后利用灰度插值方法计算出g中每个像素的灰度值;后向映射比前向映射更实用,在这种映射方式中,输出g的每一个像素灰度值都一次性由f中4相邻像素的线性插值决定。),(),(21yxhyyxhxf(x’,y’)g(x,y)基于特征的图像配准方法─空间映射常见的空间映射关系基于特征的图像配准方法─空间映射刚体变换:对象内部任意两点间的距离保持不变;刚体变换可以分解为旋转和平移:cossin),(sincos),(21yxyxhyyxyxhx旋转变换:yxtyyxhytxyxhx),(),(21平移变换:yxttyxyxcossinsincos1表示为矩阵:基于特征的图像配准方法─空间映射仿射变换:仿射变换将直线映射为直线,并保持平行性;仿射变换在刚体变换的基础上增加了尺度变换和错切变换:yxysyxhyxsyxhx),(),(21尺度变换:bxyyxhycyxyxhx),(),(21错切变换:001yxsbcsyxyx表示为矩阵:基于特征的图像配准方法─空间映射举例:假设你有2张拍摄时间相隔100年的峡谷壁的数字图像,并且你希望通过相减的处理来判断由于风化作用而产生的地貌变化。你发现一块岩石原来位于(303,467),而现在位于(316,440);一个树桩原来位于(298,277),而现在位于(311,200)。问:两幅图像有没有(a)尺寸缩放(b)旋转(c)平移?若有,有多少?若要将两幅图进行相减处理,写出第二幅图像所要做的几何变换。假定两幅图像除了尺寸上的均匀缩放、旋转和平移外没有其他几何扭曲。基于特征的图像配准方法─空间映射解:由题意有g(x1,y1)=(303,467),g(x2,y2)=(298,277);f(x′1,y′1)=(316,440),f(x′2,y′2)=(311,200);270280290300310320330340350150200250300350400450500基于特征的图像配准方法─空间映射解:原题转化为求解变换矩阵:解得:yxtsctcsyxyx1yxtsctcs112004403113162774672983039978.1197918.00043.08959.500043.07918.0T基于特征的图像配准方法─空间映射通常在h1(x,y)和h2(x,y)未知的情况下,可用求对应特征点集(至少3对)的仿射变换矩阵的方法来估计h1(x,y)和h2(x,y);在更复杂的情况下(如图像的空间变换是非线性的),h1(x,y)和h2(x,y)可用多项式来近似:其中,式中N为多项式的次数,aij和bij为各项待定系数。10101010NiNjjiijNiNjjiijyxbyyxax基于特征的图像配准方法─灰度插值经过空间变换得到的坐标值通常不为整数,这些坐标值上的灰度值没有定义,必须通过对其邻近像素的灰度值插值来得到:常用插值方法有:最近邻像素插值、双线性插值、三次立方插值;基于特征的图像配准方法─灰度插值最近邻像素插值:在待求像素的四邻点中,将距离这点最近的邻点灰度赋给待求像素。该方法最简单,但校正后的图像有明显锯齿状,即存在灰度不连续性。f(x’,y’)g(x,y)基于特征的图像配准方法─灰度插值双线性插值:双线性插值法是对最近邻法的一种改进,即根据待求像素的四个邻近点的灰度值,分别在x和y方向上进行两次插值。最后形成的插值函数为一双曲抛物面方程:计算比最近邻点法复杂,但没有灰度不连续性的缺点,结果较令人满意。基于特征的图像配准方法─灰度插值双线性插值算法:首先,在x方向上作线性插值:(,0)(0,0)(1,0)(0,0)fxfxff基于特征的图像配准方法─灰度插值双线性插值算法:首先,在x方向上作线性插值:(,1)(0,1)(1,1)(0,1)fxfxff基于特征的图像配准方法─灰度插值双线性插值算法:然后,在y方向上作线性插值:(,)(,0)(,1)(,0)fxyfxyfxfx基于特征的图像配准方法─灰度插值双线性插值算法:最后,得到双线性插值公式:(,)(1,0)(0,0)(0,1)(0,0)(1,1)(0,0)(0,1)(1,0)(0,0)fxyffxffyffffxyf基于特征的图像配准方法─灰度插值最近邻像素插值和双线性插值比较:OriginalNearestNeighbourBilinear基于特征的图像配准方法─灰度插值举例:假设f(109,775)=113,f(109,776)=109,f(110,775)=105,f(110,776)=103,试分别用最近邻像素插值法和双线性插值法求f(109.27,775.44),写出双线性插值变换方程f(x,y)=ax+by+cxy+d,求出各参数的值;答案:最近邻像素插值:f(109.27,775.44)=113双线性插值:f(109.27,775.44)=109f(x,y)=-8(x-109)-4(y-775)+2(x-109)(y-775)+113主要内容:1图像配准概述;2基于特征的图像配准方法;3基于模板的图像配准方法;4MATLAB图像配准;第九章图像配准*基于模板的图像配准方法─模板匹配模板匹配法:在一幅图像中选取一个窗口作模板T,然后将模板在另一幅图像中平移,通过相关函数的计算来找到它在搜索图中的坐标位置。模板覆盖下的那块搜索图叫做子图Si,j,(i,j)为子图的中心点在S中的坐标;模板匹配法采用使图像间相似性最大化的原理实现图像间的配准。用以下测度来衡量T和Si,j的相似程度:MmMnMmMnjiMmMnjinmTnmSnmTnmSP112112,11,)],([)],([),(),(基于模板的图像配准方法─模板匹配P值介于0和1之间。根据经验取某个阈值P0,如果PP0,则匹配成功;PP0,则匹配失败;为了加快搜索速度,可以使用金字塔图像。对图像进行一次采样率为1/n的重采样,即把图像的每n×n个像素变为一个像素,这样就得到一幅长、宽都为原来1/n的图像,把它作为金字塔的第二层。再对第二层用同样方法进行一次采样率为1/n的重采样,又得到第三层(顶层)。原始影像作为金字塔影像的底层。基于模板的图像配准方法─模板匹配金字塔图像匹配步骤:第一步:顶层的匹配,得到一个平移初始值。第二步:根据平移初始值乘以n得到第二层平移量初始值,在它m×m个像元的邻域内进行模板匹配。第三步:根据第二层匹配值乘以n得到第三层平移量初始值,再进行一次模板匹配。如果图像尺寸不是特别大,可以只用两层金字塔。基于模板的图像配准方法─模板匹配相关测度举例:主要内容:1图像配准概述;2基于特征的图像配准方法;3基于模板的图像配准方法;4MATLAB图像配准;第九章图像配准*MATLAB图像配准─图像的空间变换创建空间变换结构maketform()语法:tform=maketform(type,parameters)说明:第一个输入变量type可以取’affine’、’projective’等,用于
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