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PUBMED数据库的检索大纲Pubmed及Entrez平台介绍基本检索、高级检索主题词检索检索结果的过滤及处理PMCPubmed是生物医学学领域最权威的免费文摘数据库。由美国国家医学图书馆(NLM)管理下的国家生物技术信息中心(NCBI)建立的生物医学文献数据库,使用NCBI的Entrez检索平台。简介PubMed收录的文献量目前已过2400万篇,近年报道文献呈逐年递增的趋势,年报道文献量80多万条,每周更新。其主要收录期刊以及部分在线图书。时滞短,可以提供提前发表文献(inprocess)简介简介学科范围:主要涉及医学、药学、护理学、健康保健、兽医等学科。部分文献(约5%)提供免费全文。提供Link,Linkout指向免费全文或者电子期刊全文数据库中的全文简介PubMed的数据构成:OldMedline(-1945)Medline(1946-)PreMedlinePublisherSuppliedCitation简介MEDLINE目前收录了1946年以来全世界87个国家和地区39种语言的5600余种生物医学期刊,1900万篇文献,其报道的文献量占PubMed总的文献量达92.7%,英文刊物约占80%;3/4的文献有英文摘要,每周更新。美国来源文献占45%,91%有英文摘要。内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。MEDLINE的数据均进行过主题词标引,其可以使检索结果更加准确和全面。记录标注[PubMed-indexedforMEDLINE]简介PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,并进行加工(主题标引等),加工完成后每周向Medline数据库进行添加。记录标注[PubMed-inprocess]简介出版商直接向PubMed递送的电子文献。记录标注[PubMed-assuppliedbypublisher]PublisherSuppliedCitation访问方式平台()Entrez资源整合系统可检索NCBI提供的30余个数据库,且系统内数据库间广泛多项联系,这种联系可通过检索结果中Link连接实现。Entrez平台Entrez所包含的数据库类型多样,基因序列、结构、文献、基因组等有机结合。文献数据库:生物医学方面的期刊图书等,PubMed、PubMedCentral、OMIM、Books分子数据库:Nucleoticidesequencedatabase、Proteinsequences、Structrue基因组库:Genome、Cancerchromosomes系统工具\数据库分析工具:BLAST、GenomeAnalysisEntrez数据库系统Entrez平台在各数据库中的命中结果PubMed主要可检索字段AD作者地址ALL所有字段AU作者EDAT文章录入PUBMED的日期GR资金资助号、LA文章出版语种MAJR主要Mesh主题词MHMesh主题词PS人名作为文章的主题词PG期刊页码PMID文献在PubMed中的号码PT文章出版类型RN酶号或化学物质登记号SB用于限定PUBMED下属的某一子集,如EDLINE,PREMEDLINE,AIDS)SI第二来源标示符TA期刊全称、简称、ISSN.号TI文章英文题目TIAB题目/文摘TT音译题目TW自由文本次(题目或文摘词)VI期刊卷PAsmithjc[au]genetherapy[ti]PubMed记录样例检索规则逻辑运算符截词符词汇自动转换精确检索……布尔逻辑运算逻辑词符(AND、OR、NOT)lungANDapoptosis;vitamincORascorbicacid;LeadpoisingNOTchildren运算优先级为:()NOTANDOR例如:drugtherapyAND(asthmaORhayfever)截词检索无限截词符:*只有右截词,自动关闭自动匹配与转换功能。infect*包括infections,infective,infectivity,infector等但不包括infectioncontrol。词汇自动转换系统会自动将检索词语转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。——智能功能lungANDapoptosis自动转换为:(lung[MeSHTerms]ORlung[AllFields])AND(apoptosis[MeSHTerms]ORapoptosis[AllFields])精确检索——“”如果在短语上加半角双引号“”后,系统将不再进行自动转换,而进行精确检索。例如“singlecell”“oxygenfreeradicals”检索方法与技巧基本检索-BasicSearch高级检索-AdvancedSearch主题词检索-MeSHDatabases检索结果过滤—Chooseadditionalfilter基本检索特点可以输入任何字词,包括关键词、标题、作者、作者单位、主题词,甚至一句话,系统会自动识别并自动匹配(智能功能)进行检索。可以输入逻辑检索表达式HIFUANDcancer可以进行字段限制检索:ultrasound[MH]PubMed检索式输入框帮助工具个性化服务更多资源新功能基本检索演示例一:HIFUANDcancer例二:检索2013年诺贝尔生理学与医学奖获得者JohnO'Keefe的文章(注意:姓在前,名在后)检索结果页面演示检索结果过滤与限定显示格式的改变标题中的检索结果在PMC中免费获得全文年代分布练习并比较检索结果proteininteraction“proteininteraction”“proteininteraction”[title]高级检索主要功能是提供字段进行字段限制检索,逻辑组配检索,根据检索需要,进行逻辑组配,生成复杂检索表达式。高级检索演示检索有关问卷调查法(Questionnaires)调查病人满意度(PatientSatisfaction)的文献。检索南京医科大学(nanjingmedicaluniversity)2014年发表的文献主题词检索PubMed使用的是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表MeSH词表。优点:主要体现在主题词本身的规范性及扩展、组配等方面,具有很好的准确性与专指性。缺点:主要表现在最新文献及新概念的缺失与时滞性上主题词检索演示检索有关肺癌的护理方面的文献要求扩展下位概念,限定在主要主题词中主题词检索在用自由词检索时,系统会自动把自由词转化为相应的主题词。而有的自由词没有转化成相应的主题词,或者用主题词检索时没有检索到对应主题词,可先用自由词检索,再浏览检索结果,在密切相关文献中可打开PublicationTypes,MeSHTerms字段,查看其标引的MeSH主题词,可帮助选择正确的MeSH主题词,或扩展我们没有考虑到的主题词。有些文献,如中药汤剂类的,要注意主题词与自由词的结合使用。主题词检索主要事项其他检索功能单篇引文匹配器临床咨询期刊检索单篇(批量)引文匹配器Single/BatchCitationMatcher临床咨询ClinicalQueries专门为临床医生设计的检索服务,包括SearchbyClinicalStudyCategoryFindingSystematicReviewsMedicalGeneticsSearchesSearchbyClinicalStudyCategory查找疾病的etiology、diagnosis、therapy、prognosis及clinicalpredictionsguides文献,综合考虑检索结果的敏感性(broad,sensitivesearch,查全率较高)与特异性(narrow,specificsearch,查准率较高)FindingSystematicReviews提供systematicreviews、metaanalysis、reviewsofclinicaltrials、guidelines等循证医学文献MedicalGeneticsSearches查询疾病的遗传学文献,有ALL、Diagnosis、DifferentialDiagnosis、ClinicalDescription、Management、GeneticsCounseling、MolecularGenetics、GeneticsTesting等选项临床试验ClinicalTrialsNIH研发的临床试验数据库,收录了全球由国家拨款或私募经费资助的各项试验目录。目前收录了全球180多个国家登记的临床试验的数据超过17万,是重要的循证医学数据库。提供基本检索、高级检索、按主题浏览演示ClinicalTrials的检索期刊检索可以查看期刊的相信信息,包括全称、简称,出版社,电子全文链接等,也可以检索该刊上发表的文章检索结果处理检索结果显示、保存检索结果的过滤全文获取Myncbi个性化服务检索结果的处理在文献管理软件中对结果进行分析、标准化处理等过滤器(filter)的使用演示全文的获取全文的链接:提供电子全文的链接免费的全文链接:OpenAccess、PMC无电子全文的,提供馆藏链接电子全文链接免费的电子全文PubMedCentral(PMC)PMC是NCBI建立的免费生命科学和医学期刊文献全文数据库,用户可以不受限制的下载全文。PMC收录的期刊自愿加入的。PMC还收录了NIH基金赞助项目发表的论文。完整收录的期刊1676中,NIH期刊306种,选择性收录期刊3183种。个性化服务功能保存检索策略定期跟踪某一课题的进展File:将全部检索结果或选择数据保存到本地电脑中Clipboard:其暂时保存作用,最多可以保存500条记录。从剪贴板中可进行保存到本地电脑、发送到邮箱等操作。Collections:将文献添加到个人文献集中,需要登录myncbi.E_mail:将文献发送到个人邮箱,不需要登录myncbi.Order:向NLM订购全文MyBibliography:需要登录myncbi,将检索结果添加到我的书目数据库中。将PubMed检索结果导入文献管理软件中PubMed检索2000年以来有关65岁以上老人阿尔茨海默病(AlzheimerDisease)死亡率(mortality)的多元分析(metaanalysis)文献65metaanalysis2000AlzheimerDiseasemortality减肥药(Anti-ObesityAgents)的副作用方面的最新英文文献?(要求涉及的研究对象为19-24岁的年轻女性)Anti-ObesityAgentsadviseeffectEnglisharticles19-24female检索有关用问卷调查法(Questionnaires)调查病人满意度(PatientSatisfaction)的文献,比较主题词检索与自由词检索的异同
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